香港機場預計採取填海造陸方式，擴建第三條跑道，然此海域範圍同時也是數量稀少的中華白海豚活動棲地，建造工程恐危及白海豚生存。20日機場管理局發佈環評報告書，環團質疑其未詳細掌握、考量白海豚的活動習慣和生態，內容淡化了開發對環境的衝擊，於是在網路上發起社群連署，表達抗議。
香港海豚保育學會會長洪家耀表示，報告內容不盡實，評估草率粗疏、錯漏百出，低估了工程對中華白海豚帶來的嚴重負面影響；補償措施亦不足，未能應對計畫帶來的嚴重環境影響。
世界自然基金會香港分會（WWF）也怒批，機管局對保育海豚毫無決心和誠意，要求當局重新審視環境補償方案的成效，同時立即在三跑工程開展前在西部水域設立2個海岸公園。WWF認為，若海岸公園須延至2023年落成，屆時中華白海豚極有可能已自香港水域絕跡。
工程僅致中度影響？ 環團：環評報告不確實
根據機管局環評報告顯示，第三條跑道填海範圍被確認為重要海豚棲息地，海豚在日間會匆匆路經此處、往來不同活動核心區；夜間更會停留該處覓食或進行其他活動。如在此水域進行大型填海工程，將永久摧毀一大片海豚重要棲息地；從保育角度來說，10年間，香港水域的海豚數量大幅下降，無法承受此大型填海擾動，影響程度更非機管局所說，只屬「中度影響」。
香港海豚保育學會指出，此環評報告內，更忽視了兩個事實︰
- 評估一片水域作為海豚生境的重要性時，應考慮牠們如何利用該水域，如覓食、休息、作移動路線路過等；作為海豚出沒範圍，整個珠江口、或香港西部水域重要程度亦不同，故評估填海佔了多少海豚棲地，應以牠們利用此水域的方式為基礎來比較。
- 填海範圍所處之北大嶼山水域十分獨特，很多經常生活在香港水域的海豚長期在此停留，而針對在北大嶼山水域生活的族群，填海範圍便是其生活範圍的一大部份，因此影響必定深遠，不能因此水域相對小，而忽略其對海豚的重要性。
填海、高速船干擾 白海豚生存難
香港海豚保育學會也指出，因機場第三條跑道大型填海工程，大幅削減海豚移動走廊面積達5成，再加上未來的高速船航行更趨頻繁，將嚴重阻礙海豚往來不同重要棲息地；而當港珠澳大橋口岸人工島完工後，更會阻擋海豚重新使用新設立於大小磨刀洲的海岸公園。
環評報告著重評估工程船隻速度帶來的影響，卻完全忽視其數量問題。根據港珠澳大橋填海工程的經驗，大量船隻勢必出現在工程範圍附近水域，然環評報告不只未提及船隻數量，更避談船隻進出頻繁，威脅海豚生存。
而報告中雖也明確表示，在跑道填海施工期間，海豚的移動路線將受嚴重影響，卻未提供任何補償措施，令海豚能暢通無阻地來往各重要棲息地(尤其是來往兩個海岸公園之間的重要通道)。此嚴重疏忽將導致新成立的大小磨刀洲海岸公園，失去其作為填海補償措施的功用。
事後補救？ 機管局：海豚遇工程會自行避開
只是，新海岸公園將在跑道填海工程結束後才成立，對白海豚造成危害後，還能發揮補救功能嗎？對此，機管局建築工程環保事務總經理李仲騰回應，工程確會影響區內海豚，但工程期間滋擾大，設立海岸公園未必能達保育效果，故留待工程後才著手建設2,400公頃的海岸公園。他引述環評報告聘用海豚專家意見，指海豚活動範圍大，遇上工程都懂得避開。
洪家耀則拒絕接受此說法，他指出，之前港珠澳大橋填海工程已令海豚在大嶼山東北水域絕跡，第三跑道工程更可能導致海豚不再出沒於北大嶼山海域。他更反問李仲騰，「你現在住香港，怎麼不回中國住？道理是一樣的，因為香港是你熟悉的、維繫社群的地方，海豚也一樣，北大嶼山就有個社群」。他表示，珠江海域環境急劇惡化，一旦海豚離開香港，將無處容身。
雙方也對環評研究方法持不同看法，洪家耀認為，白海豚白天會路過施工區，夜間則在區內覓食。不過機管局未詳細研究海豚夜間生態就填海，將嚴重阻礙海豚棲息及活動。他批評環評報告愚弄專家。李仲騰則強調，夜間水底監測技術存在限制，目前無法施行。
白海豚存亡之秋 環團籲以最謹慎原則評估影響
環團認為，白海豚生存狀況的危及程度不容忽視。他們期望機管局能審慎以對，採「最保守原則」(pre-cautionary principle)來評估影響，既然環評報告對白海豚之影響評估及補償措施明顯不合格，理應撤回重做，不應草率通過。
學會也將發起保育活動，目標是收集1萬份公眾意見，讓政府看見民間的保育決心。
