耗資250億美元的三峽大壩工程，自從2003年6月三峽工程進行首次截流以來，庫區部分岸線已多次潰堤。隨著工程推進形成綿延約644公里長的靜止水域，不斷上漲的水位迫使農民向高處尋找可耕種的土地，而那些地方本已聚集大量貧困人口，遷居人口不僅難以就業，也享受不到公共服務。此外，未經處理就流入水庫的污水和農用化學品也急遽增加。

中國10月間宣佈，今後10到15年大壩地區居民還有400萬人將移居他處，人數多達初建大壩時的3倍。北京如何因應這項挑戰，將嚴重影響當地環境生態和政治穩定。目前大壩水位已上升約157公尺，估計到2009年還將上升19公尺。官員聲稱，大壩建成後形成的新江岸有60％過於陡峭，無法耕作。批評人士警告，大壩附近主要大城市重慶的長江碼頭，10年內將因江水流速下降導致淤泥積聚而報廢。

目前，重慶西面一帶等大壩水域上游城市沿江地區已被污水帶包圍。世界自然基金會今春發表的報告指稱，由於大壩橫亙江面，上游污水無法比照以往模式被一路沖刷入海。進入庫區靜止水域的污水及其他污染物會倒流進支流，導致藻類暴增。由於水流中斷，長江盆地漁業作物將大幅減少。