澎湖縣長王乾發3月11日指出，縣府復育計畫分短中長程，短程以放流藻食性及適合社區自主管理魚種為主，中程向中央爭取成立復育推行小組，長程則與內政部推動望安鄉東嶼坪、西嶼坪、東吉及西吉四座島嶼周邊海域劃設為海洋國家公園，將是繼東沙環礁國家公園之後，台灣第二座海洋國家公園。今年已由海洋國家公園管理處著手規劃，並與當地居民溝通，若一切順利，預計民國100年可具雛型。

澎湖南方四島珊瑚礁群，各種軟珊瑚等種類繁多，且未受到破壞，珊瑚產卵後往北漂到澎湖內海著床，也造就了澎湖青灣內海豐富的珊瑚生態，有必要及早保育。澎湖縣農漁局長鄭明源說，目前尚未確定澎湖海洋國家公園劃設範圍，不過會類似像墾丁部分海域劃為保護區一樣，部分海域禁止使用網具捕魚，部分海域則畫為觀光浮潛區，供遊客欣賞海底珊瑚世界，不過由於當地漁業權可能受影響，應與居民溝通。