立法院衛環委員會於15、16日審查溫室氣體減量法草案，但因母法內未明定減量總目標和期程、政府部門減量政策無具體行動時程、碳排放權的分配爭議大等諸多缺失，許多法條都被保留。最後因數名立委意見分歧，決定散會、擇期再審。
環團、立委批：缺少減量目標、基準年
環保團體痛批環保署送審的溫室氣體減量法是落後的「唬爛版」，「不想減重只量體重」。台灣環境行動網秘書長潘翰疆指出，目前審議的行政院版本大致與2007年5月7日所審議的行政院版本相似（詳見附件），並且還刪除了減量期程的努力目標以及各部門減量的實施時間等。綠色公民行動聯盟、台灣環境行動網、綠黨、台灣環境資訊協會等團體，在立法院群賢樓外，高喊「沒有期程沒法減量」的口號，呼籲不要通過沒有減量目標的溫室減量法。
馬英九曾在其環境政策白皮書中，提出中長期減碳目標：排放量於2016~2020年回歸2008年、於2025年回歸2000年、於2050年回到2000年排放量的50%。潘翰疆認為，馬英九有義務約束國民黨團與立委，提出符合政見與人民期待的法案。民進黨看守內閣不應在下野前提出政院版的環境倒退法案。環保團體共同呼籲比照附件一國家以1990年為減量基準年，才能與國際接軌，符合世界潮流。
15日的衛環委員會上，多位立委也認為，母法中應加入減量目標的期程。環保署則解釋先進國家中只有英國將溫室氣體減量標準訂在母法中，日本雖根據京都議定書，但法律條文並未明定。環保署長陳重信最後表示：「會尊重立院規定」。
污染越多，資源越多？ 碳排放權備受爭議
另一方面，綠色公民行動聯盟秘書長崔愫欣表示，溫室氣體減量法改成溫室氣體「盤查法」比較名符其實。環保署目前正在推動溫室氣體盤查、登錄的工作，希望法源通過後，可以建立碳交易制度。但在行政院版的溫室氣體減量法中，第14條與第15條，強調溫室氣體排放量無償「核配」給各公告排放源的所屬單位，引發環保團體「污染越多，資源越多？」的質疑。
立法委員黃淑英也認為，推動溫室氣體減量，不該是由某既定的廠商牟利，而且「重點應在減量而非市場商機」。對此，環保團體也共同提出聲明要求，不應無償將撥給既定排放源使用，應參考國際既有制度之缺失，訂定具有環境效益與社會正義之分配方式。
16日的委員會上，審查到第14-16條碳排放權的法條，針對核配是否有償、保留給新廠商核的比例、最佳可行技術等問題，立法委員各有不同意見。林淑芬、黃淑英、田秋堇等立委認為至少要調整至上次委員會通過的15%有償，而主席鍾紹和卻宣稱配額無償、國有化才符合社會正義，有償核配會加重小企業負擔。
因太多爭議未達共識，黃淑英和田秋菫提出停止審議、另開公聽會廣納意見後再審的要求，其他立委才同意第14-16條保留。原本16日下午要續審剩下的法條，但最後因保留法條多於達成共識，多名立委不願參加下午的會議，希望溫室氣體減量法修正後再審，使得主席鍾紹和不得不宣佈，下午會議取消、擇期再審。
附件一、2008年立院審查的溫室氣體減量法-行政院版本(完整版)
附件二、2007年年各版本-070522民間討論會(重點版)
