「生態系組織」宗旨在於創造人類與野生生物共生的聚落。本組織正積極地從事土地保護，並野放違法飼養的野生鳥種。
由於造林政策及其他因素，熊本縣95%的原生林都被日本柳杉、雪松與日本扁柏、白扁柏的人造林所取代，對天然生態系造成不少嚴重地破壞。
看到這種嚴重的情況，「生態系組織」於1986年1月成立，其目標為：恢復熊本縣原生樹林，開始植樹，造林並監管野鳥盜獵情形。1998年8月，生態系組織買下了阿蘇郡南小國鎮3公頃的土地。1990年，本組織在阿蘇町鎮的西湯富野浦買了4公頃的土地，進行森林疏伐、修剪樹林與種植原生柳杉林、雪松林的工作，此處第二筆財產。
1992年的7月，本組織在上益城郡益城鎮的小池地區開始興建10公頃的生態研究公園，此公園提供人們體會、學習群落生境（biotope）的機會。1993年3月，我們又增購了阿蘇鎮端邊原野地，致力恢復其原貌，這裡是「阿蘇久重國家公園」中的3.5公頃荒野地區。1994年3月，本組織獲熊本縣政府表揚，得了第三屆熊本縣環境獎。同年7月，生態研究公園又獲得了環境署相關附屬組織「日本環境事業團財團法人」的經費－日本地球世界環境基金（Japan Fund for Global Environment）。本組織興建了包含野鳥復育之家的生態研究機構，訓練幫助被人非法飼養過的野鳥重回到它們原來的自然生存環境，當野鳥復育之家開始運作時，我們立即四處拜訪私人住家與鳥店，請他們一起合作幫助放生野鳥。
1997年1月，「生態系組織」又添購了10公頃的樹林，作為生態研究公園小樹林，這是為了擴大民眾實踐及學習生物棲域的地點，提供給民眾學習與體會群落生境（biotope）相關知識的機會。至2000年5月，此處放生的野鳥數目已逾12,000隻。
野生保護區需要有「保護者」才能達到其目標。國民信託活動並不僅止於購買土地；最不可缺少的，是永遠關心這片及保護土地的人們。我們希望有更多人願意為國民信託財產所屬土地，盡一份心力﹕除草、創造群落生境（biotope）、闢建步道、自然生態觀察、監管鳥類盜獵與盜採野花等等。南小尾國町鎮的自然觀察站能提供過夜住宿。
阿蘇國民信託樹林
熊本縣阿蘇郡町
過去以大草原聞名的阿蘇，已被人類大肆開發。原本在此區常見的金鵰（Aquila chrysaetos）已經消失，許多野花也正瀕臨絕種。
阿蘇國民信託運動在1988年，由4位民眾創立，最初購買3公頃已開墾的柳杉林與雪松林，希望復植其原生的小灌木林，並成立阿蘇野生生態保護區。1996年，本國民信託所有土地已增加至約10公頃。
生態研究公園小樹林
熊本縣阿蘇郡町
「生態研究公園小樹林」擁有高度多樣化的環境：小灌木林、草原、人造林、池塘、溪流與泉水。這裡有機會成為多種野生動植物聚集的群落生境（biotope）。我們計畫未來將此保護區由從現在的16公頃增至50公頃。
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生態系組織
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