屏東小琉球當地的生態志工發現，居民私自在沿岸設置的流刺網，除了捕魚也很容易纏住綠蠵龜；當地民眾也都在沙灘上發現過被漁網纏住的綠蠵龜屍體。學者認為，在淺灘上設置流刺網，等於把進出潮間帶的生物一網打盡，對海洋生態影響很大。

正在發展生態旅遊的小琉球，已經有當地居民自行組成志工隊，每周都發起清除流刺網的活動，也希望政府能夠明文禁止。當地漁會亦表示，希望政府能協助成立稽查大隊，一同維護應當美麗的小琉球海底。屏東縣政府則表示，在小琉球200公尺內海域都是保育區，本來就禁止捕撈，再加上流刺網並未開放讓漁民定置使用，民眾如果發現，可以拍照存證並通報，縣府將予以開罰，未來也會推動小琉球3浬內禁止使用流刺網。