台中市高美溼地分區管制，地方及生態人士多有期許，希望市府確實執行與監督，解決互花米草強勢入侵、廢污水等問題，讓溼地生態得以永續。
長期關懷地方生態的牛罵頭文化協進會理事長吳長錕表示，高美地區仍存在不少急需解決的生態問題，例如大甲溪長期淤砂嚴重，建設必須考量淤砂問題，進行監測。
台中大地鄉土關懷協會理事長蔡得永則是憂心大安水蓑衣恐絕跡，他指出，台灣特有種植物大安水蓑衣因強勢植物互花米草介入，恐逐漸消失。蔡得永說，互花米草排他性高，大舉侵犯溼地周邊，但相關單位清理作業太慢、頻率也不足，已造成溼地植物逐漸退縮。
除了自然界的威脅，人為污染也潛藏危機。台中市議員楊典忠說，高美溼地附近的清水大排常排放廢污水，直接流經溼地入海，而永續區開放遊客戲水，對生態及遊客健康勢必造成影響，市府必須重視。工作，保護區內都以自然為原則，不能有太多的人為干擾。