高雄左營蓮池潭是為符世運賽事場域需求而展開有史以來最大規模的拷潭工程，但根據高雄市政府水工處的調查，蓮池潭潭內生物現在幾乎都是外來魚種，其中琵琶鼠數量佔了30%、紅魔鬼魚約17%、泰國鱧約14%，還有少數筍殼魚、魚虎等肉食性魚類存在，合計外來魚種就佔了86%左右。至於本土物種，只剩鯽魚約8%、鯉魚約6%，合計則為14%。

高雄市長陳菊指出，人皆有好生之德，但因外來物種的入侵導致本土物種的生存空間遭到壓縮、威脅，就失去宗教「放生」儀式的原意。更何況在世界各地為培育原生物種、魚類唯恐不及的當下，任意「放生」的行為，真的很叫人憂心。

2009 高雄世運會，市府除了興建主場館與巨蛋外，其餘都將利用高雄區內各學校及社區運動設施等現有運動場、體育館做為競賽場地。

世運主場館是擁有4萬個觀眾席的400公尺田徑場兼足球場。場館採節能綠建築設計，並獲2007年國家卓越建設獎。世運項目七人制橄欖球、飛盤將在主場館競技。 高雄巨蛋則不僅是籃球、排球及200公尺室內田徑運動的比賽場地，同時也有表演、集會與展覽等用途。 世運項目體操及運動舞蹈都將在此舉辦。

世運項目的滑水、龍舟、輕艇水球等比賽場地在蓮池潭；因滑水項目需有2.5公尺以上的水深，及需具有減少回浪的設施，市府現已啟動蓮池潭改造工程。預計明年底前全面將蓮池潭潭底疏浚達水深標準，增加42萬立方公尺蓄洪量，並改造護岸、設置減少回浪構造物，以滿足比賽需求。

為了解擁有150萬人口的高雄市，在高度開發下的生物多樣性概況，高市府建設局委託專家進行初步調查發現，在洲仔溼地記錄到植物至少231種、鳥類81種，而蓮池潭也有21種魚類和54種鳥類，2處為高雄市區內最佳的水鳥棲息地，並成功吸引水雉棲息。高雄市野鳥學會接受建設局委託，將高雄市生物多樣性調查結果編印成「繽紛生態in高雄」手冊，提供高雄市各國中、小學童認識港都生物多樣性風貌。

市府近年積極推動溼地建設，較具規模的洲仔溼地、美術館溼地、本和里滯洪池溼地已建設完成，往北延伸的半屏湖溼地及援中港溼地，未來將南北串連成西高雄生態廊道。