除了福爾摩沙，衛星二號的影像外，2006年所發射的福衛三號，也發現到，這次大地震發生前，四川上空的電離層平均密度，突然降了一半，外界認為，可能是地震前兆。

2006年成功升空的福爾摩沙衛星三號，一年多來負責收取太空中大氣和電離層的資訊，在這次四川大地震前後，研究團隊發現四川上空的電離層密度有明顯的震盪。

電離層的擾動一直是地球科學界研究地震前兆的重要指標之一，這回四川大地震觀測資料顯示，四川省汶川縣方圓一千公里上空的電離層，從4月27號到5月6號，平均密度為每立方公分120萬顆帶電粒子，而在五月七號到11號，驟降到60萬顆，同樣的在去年九月七號規模七點零的恆春雙震，福衛三號也觀測到相同現象。不過學者和氣象局都強調，地震前兆的研究還沒真正成熟。