美國權威科學研究團隊提出警告，基改作物和非基改物種間的相互污染所造成的後果，將隨著新一代基改作物的出現更加惡化。基改作物和非基改作物混合生產的食品，已造成製造商在銷售和出口時龐大的經濟損失，但科學家認為，當新一代農作物被用於生產藥物和工業化學物品時，其導致的後果將更為嚴重，這些作物可能危及人體健康和毒害野生動物。

科學工作者關懷聯盟(UCS)資深食品與環境計劃分析家史帝勒曼就質疑：「假如玉米片受到某種藥物或化學物品的污染，會對社會和經濟造成什麼樣的影響？我想肯定會對經濟產生重大衝擊。」科學工作者關懷聯盟在波士頓召開的美國科學促進聯會會議上發表了相關研究結果。

根據國際農業生技產業應用服務中心(International Service for the Acquisition of Agri-biotech Applications, ISAAA)主席Clive James發表的2004年度報告，全球基因改造農作物的種植總面積已達8140萬公頃，其中種植面積最多的國家為美國、阿根廷與加拿大，前四大基改作物依序為大豆、玉米、棉花與油菜。以美國為例，其基因改造的大豆、玉米與棉花，相對於該作物總種植面積各占85%、45%與76%。