瑞芳海濱蝙蝠洞民國60年代，曾出現百萬蝙蝠齊飛的壯觀畫面，後因民眾丟擲鞭炮驚嚇，蝙蝠一度人間蒸發，直到89年才重現生機，最多時有70萬隻棲息，如今只剩30萬隻，上個月還有電信業者在洞口架設基地台，蝙蝠洞處境雪上加霜。

台灣蝙蝠學會秘書長徐昭龍指出，93年學會開始藉由科學儀器，調查海濱蝙蝠洞生態，當時估計數量應超過70萬隻，高居全球蝙蝠聚集數量前5名，往後卻逐年遞減，94年減為50萬隻，去年40萬隻，今年僅剩30萬隻。 而蝙蝠數量驟減原因，包括瓜蓬改變洞口形態；洞口因施肥產生異味，讓蝙蝠找不到家；員山子分洪道當年炸山，蝙蝠洞內疑有大面積因此坍塌，造成棲息空間縮小。

茂林國家風景區野溪溫泉自然環境優美，未管制休旅車進出，遊客任意直駛溪谷戲水遊憩頻繁，近來卻發現生態遭破壞情形嚴重，除可見休旅車橫行外，甚至直接駛進野溪溫泉泡湯遊玩，破壞自然生態，遊憩過後還遺留垃圾污染環境，卻未見茂管處採取管制行動。茂林國家風景區管理處表示，目前並無現行法律足以規範遊客不當行為，僅能依觀光發展條例，以安全、河床危險為考量，及有破壞生態及農作物之虞，當場規勸遊客改善。將函請主管機關公告禁止休旅車進入溪谷區域，並嚴加取締不當行為。