黃河三角洲生態環境近年來持續改善，鳥類數量增加上百種，成為東部沿海地區少見的鳥天堂。

上世紀90年代以來，黃河枯水年份增多，多次發生斷流，導致黃河三角洲生態惡化，大片濕地變成鹽鹼地，許多珍稀鳥類飛離黃河口。從1999年開始，中國對黃河水量進行統一調度，黃河免除了斷流之虞，生態環境逐步改善，黃河三角洲自然保護區借機啟動鳥類保護工程，前來越冬和棲居的鳥類迅速增多。

目前，黃河三角洲自然保護區已成為我國東部沿海少見的鳥類聚集區，鳥類數量由黃河斷流期間的180多種增加到280多種，丹頂鶴、白枕鶴、灰鶴、白鸛等珍稀鳥類常年在這裏棲息繁衍。

黃河三角洲自然保護區管理局有關人士介紹，他們最近觀測到被列爲國家2級保護動物的「短耳」，這種鳥類還是首次在保護區內被發現。國家1級保護動物黑鸛、白鶴及銷聲匿迹數十年的雪雁，最近也在黃河口現身。

黃河調水調沙之前，由於過度開發，黃河水資源嚴重不足，黃河口濕地面積逐年縮小，產生大面積荒地，濕地乾涸，海水倒灌，野生蘆葦等濕地植被退化，一些依賴濕地生存的動植物也明顯減少。2002年起，調水調沙帶來的大量河水使黃河口濕地生態環境因此大為改觀。生物多樣性資源日益豐富，生態向多樣化、穩定性方向發展。

據估計，自2002年黃河調水調沙以來，黃河口濕地以年均5萬畝的速度增長，總面積現達5200多平方公里。濕地內蘆葦面積增加到6萬公頃，13萬畝人工檉柳林全部成活，保護區內野生植物達393多種，鳥類增加到283種。