由行政院核定，鎖定全國農地工廠的「保護農地-拆除農地上新增違規工廠」方案執行至今，首波名單17家工廠已拆除5家，達成率29%。其中，台南市與嘉義縣100%拆除完畢，高雄拆除2家，尚有3家待拆。彰化與雲林至今仍掛零。
今（4）日農委會、內政部、與經濟部舉行聯合記者會，宣告首波17家工廠將於三月底前拆除完畢，下一波名單將於年後公布，已知至少十家工廠。
對於彰化、雲林遲遲不開拆，農委會表示6家已超過改善限期的「施工中」農地工廠預計一個月內拆除。目前拆除進度在掌控中，中央還不會代位拆除。
彰化、雲林至今掛零 首波17家三月底拆除完畢
「保護農地-拆除農地上新增違規工廠」行動方案由行政院於2017年10月核定，是第一個由中央發起，全國配合執行的農地工廠拆除專案。首波拆除名單共17件，主要是針對2016年5月20日以後新增的農地工廠。
17家農地工廠分二大類，9家為查報時還在「施工中」的農地工廠，縣市政府先勒令停工，一個月後不拆除則強拆。8家為查報時「已完工」的農地工廠，勒令停工一個月未拆者先執行斷水斷電，再一個月還是未拆才會強制拆除，拆除時程較長。
12月初，台南與高雄首先展開拆除行動，嘉義縣隨後加入，三縣市共拆5件。但「施工中」的農地工廠還有6件未拆，5間位在彰化，1間位在雲林，均已超過限期改善的期限。「已完工」也有6件未拆，3家彰化，3家高雄。
內政部次長花敬群表示，6件未拆的「施工中」的農地工廠將由縣市於一個月內拆除完畢。「已完工」的農地工廠則於本月執行斷水斷電，如仍未拆除，則二個月內執行強拆。農委會補充，首波17家將於三月底全數拆完。
彰化、雲林遲遲不開拆，中央是否考慮代位拆除？農委會副主委陳吉仲表示，雲林預計在本月底拆除完畢。彰化可能因為跨單位連絡上需要較多時間，但「施工中」工廠預計本月底前也會先拆完。進度都還在掌控中，不會動用中央代位執行拆除。
第二波鎖定十家以上 過年後公布名單
這波拆除行動由中央經濟部、內政部、國發會、農委會四個部會主導，拆除經費由中央農業發展基金全數補助。第二波拆除行動已在規劃中，目前鎖定至少十家。
農委會企劃處處長蔡昇甫解釋，第二波還需釐清拆除範圍，詳細的名單預計年後公布。將比照第一波的方式上網公告清單與拆除進度。
農地工廠佔13000公頃 鎖定「新建」目的在「止血」
根據農委會盤點資料，全台已有1.3萬公頃農地被農地工廠占用，本方案至今僅拆5家，實在杯水車薪。對此，陳吉仲解釋，行動方案重點不在拆除所有農地工廠，而是「止血」，讓社會知道，農地絕不可能再讓工廠進駐。
花敬群補充，大面積、大範圍被違章工廠佔據的農地需要計畫性的處理。在未來的「國土計畫」中，如果是高汙染工廠，還是必須強制搬遷至產業園區；如果是農業生產相關的工廠，則規劃為農業發展地區第四類；如果是非農業相關的工廠，則規劃為城鄉發展地區第二-3類。後二者均非就地合法，還是要先進行污水處理、公共設施等園區規劃和回饋機制。
