管理不彰的農業對濕地將造成多方衝擊，恐對濕地生態特性產生不良影響，使人們永久失去溼地帶來的好處。
水量與水質衝擊
對水量的影響：
為灌溉等緣故興建水壩、抽取地表水及地下水等，造成逕流量減少；灌溉水回流或水壩洩洪所造成的水流量增加；河水流動型態與時間點的改變，將大大地影響並危害濕地生態特性，因為不少沿岸濕地仰賴河流帶來的養分、懸浮物以維繫其功能。
對水質的衝擊：
集約養殖等常帶來大量污染，如農藥、化肥、抗生素和消毒劑等，不僅影響內陸及海岸濕地的生態特性，也對人體健康及濕地所供給的飲用水質造成衝擊。
擾亂濕地機能及生態系服務的農業活動，包括：將濕地轉為耕種或養殖使用、引水灌溉行為、引入外來物種、引入人類或動物疾病媒介、干擾濕地動物的遷徙和覓食型態，如集約養蝦池的快速擴張。上述行為大量壓縮許多國家的海岸濕地，諸如海岸保護、漁業及紅樹林產物等濕地生態系提供的服務也一同消失。
數字會說話
農業用水：我們用了多少水？這如何影響濕地？未來數十年將會如何？我們有足夠的水供越來越多的人口使用嗎？
從地表水和地下水抽取的水中，有70%用於農業，大部分用以灌溉，有些會流回河流或地下水層中，其餘的則蒸散到空氣。
大約有40%的灌溉面積以地下水──或配合其他水源──作為灌溉用水的主要來源。
據估計，目前農業用水可滿足灌溉需求者占20%，其餘須依賴降雨。全世界「看天田」和「灌溉田」的比例差異極大。
預測至2050年，全球農業用水─包括看天田和灌溉田─將增加19%，用以生產食物、紡織材料及生質能。而不少水資源已不足的地區，未來將增加灌溉用田水量。
目前全世界用於作物生產的陸地面積比例為11%。農業生產在過去50年成長為近3倍，但總耕地面積僅增加12%，顯示高度的集約農業，灌溉面積亦在這段時間中增加為2倍，占增加40%的產量。
在1970年至2008年，養殖食用魚的產量每年平均增加6.6%，魚隻對土地、水及飼料的需求也因而增加，同時造成內陸和海岸濕地的壓力。
註：以農產品生產總值計算，圓餅圖係以呈現各區域作物水分蒸散總量(單位為立方公里)。
全球水資源利用已經逼近或超過其維持永續的臨界點，未來的農業需要更多水資源，以供養更多人口，而濕地也必須保留足夠的水量，以維持其生態特性及重要的生態系服務；未來的農業需要更多土地，以供養更多人口，但在濕地發展農業將損失重要的濕地生態服務機能。
拉姆薩公約定義濕地的生態特性為：「生態系中各種成分(溼地中的物理、化學及生物成分)、各種程序(濕地中自然發生的物理、化學及生物變化)、其效益/服務(濕地提供給人們的利益)之組成，並在特定時間形成的濕地樣貌」。
