大安溪的鯉魚潭水庫和大甲溪的石岡壩，是大台中地區的用水來源，當水利署提出大安溪、大甲溪聯合運用的輸水工程，下游農民卻擔心，農業用水被犧牲，質疑這個開發案是為科學園區而興建，究竟這個開發案水要給誰？
停棲在電線上的白頭翁，是花農最討厭的訪客，即使已經張起防鳥網，這些投機客還是有辦法偷襲百合花。覬覦百合花的還有採花賊，為了確保巨額的投資不至於化為烏有，農民在田地旁邊放置小型的貨櫃屋，在宵小橫行時，就要夜宿田邊看顧百合花。這些風險都不比科學園區進駐后里來的高，農民擔心，高耗水產業進駐，對水資源的排擠效應，因為后里地區的農業用水，並不充裕。
后里夾在大安溪和大甲溪之間，大安溪有鯉魚潭水庫提供大台中地區的工業和民生用水，台中農田水利會的后里圳位在鯉魚潭水庫的下游，農民表示，鯉魚潭水庫在上游把水取走，后里圳的水量不夠給農業使用，所以灌區內的后里鄉、外埔鄉兩千多公頃的農地，長期以來都是分區輪灌。花農陳欽全表示，萬一缺水，就會要求農業休耕，以維持民生、工業用水，花農的損失是以百萬起跳，百合花的球莖遠從荷蘭進口，前一年就要預定，既不能退貨，也不能放到隔年再種。
大台中地區的農業、工業到民生用水，主要來自大安溪和大甲溪，九二一大地震徹底改變了大甲溪的面貌，脆弱的山林、土石鬆動，在大雨沖刷下，土石崩落堆積在河川，更讓大甲溪水變得渾濁，雖著濁度上升，豐原淨水場的供水能力跟著下降，為了提供大台中地區穩定的水源，水利署提出大安大甲聯合運用的輸水工程。
水利署表示，台中地區的供水系統缺乏備援系統，大安大甲聯合運用的計畫當大甲溪濁度高時，可以從鯉魚潭水庫支援整個大台中地區的用水，兩條溪流的水量也可互相支援，在豐水期，多取大甲溪的水，鯉魚潭水庫的水儲存至缺水期使用。
這個工程的內容，是在鯉魚潭水庫增設一條輸水管線，每天可輸送110萬噸水到后里，並興建后里第一淨水場，同時利用石岡壩的攔水功能，開鑿一條隧道，每天最高可輸送150萬噸的水，另外設置后里第二淨水場。但是，因為后里第一淨水場就設在中科三期后里基地裡面，供水量每天20萬噸，而中科三期的總用水量就有15萬噸，再加上中科三期后里基地的環評說明書中清楚寫著，科學園區用水來自石岡壩，原水送到鯉魚潭淨水場或是新設的淨水場，就近提供給后里基地使用，這與水利署的大安大甲聯合運用，從石岡壩引水的方式是一樣的。
農民質疑，大安大甲聯合運用，是為中科三期量身訂做，如果是為了大台中，為什麼在后里做兩個淨水廠，直接在豐原淨水場旁邊，或就近在石岡鄉做淨水場就好，何必大費周章。水利署表示，豐原淨水場原來管線老舊，如果管線重新處理，對豐原市區衝擊大，才會選擇衝擊量小，在石岡壩利用隧道，把水送到后里淨水場。
這個開發案要新設兩個淨水場，在環評會中，自來水公司表示，后里第二淨水場是大台中地區的備援系統。而農民則認為，第一淨水場就是給中科使用，水利署回應，實際調水，不管蓋在哪裡，都是往台中、后里送水。花農陳欽全表示，在大安大甲的環評說明書中，有寫到后里淨水場支援台中一期、三期的用水，而且是在后里科學園區第三期進駐後，水利署才提出這個計畫。
潺潺溪水在水圳裡流動，內埔圳密密麻麻的穿梭在后里、外埔的農地間，每到春耕，田間常常看到農民忙碌的身影。農民廖明田和花農陳欽全一樣憂慮，因為內埔圳位在石岡壩下游，枯水期水就很缺乏，如果水又給科學園區使用，對農業的影響很大。
由於在大安溪、大甲溪有許多台中農田水利會的取水口，水利署表示，大甲溪只取豐水期的水，大安、大甲兩條溪流農民的用水量一定會保留。如果風調雨順，農民並不會擔心，最怕是遇到枯旱年，到時候，水資源該如何分配？
花農陳欽全認為，工業、農業應該同時並重，不能將來缺水，優先供應給工業區，讓農民休耕。水利署表示，如果影響民生和工業用水，農業用水被調用，停灌補償每公頃八萬元，至於高經濟作物和景觀作物，會做個案處理。
陳欽全表示，休耕補助的部分，水利署都沒回應怎麼處理，因為后里有將近兩百公頃的百合花田，一分地，光是球莖成本就要60萬，農民投資百萬、甚至千萬的成本，萬一要調用農業用水，衝擊會很大，所以他不希望休耕。
除了水資源的爭議，工程的安全性也引發質疑，在九二一大地震，車籠埔斷層直接通過石岡壩，造成壩體受損，而大安大甲聯合運用，在石岡壩前方開鑿隧道引水，正是斷層經過的地方。台灣生態學會顧問張豐年表示，萬一將來地震錯動，輸水管線會嚴重損毀，相當危險！水利署回應，施工期間會加強灌漿處理，增加混凝土厚度，萬一地震錯動，修復不會造成問題。
引水隧道利用石岡壩既有的攔水功能取水，但是石岡壩淤積嚴重，砂石車在河床上不斷來回清運砂石，原本十幾公尺深的河道，已經淤的跟河岸旁的住家一樣高，當颱風豪雨期間，居民飽受水災之苦。如果莫拉克颱風的大雨降在大甲溪流域，洪水夾帶土石的撞擊力，石岡壩能否經得起考驗。
水利署表示，颱風期間石岡的壩閘都會開，砂石、水會排出去，頂多淤的跟壩頂一樣高。但台灣生態學會顧問張豐年質疑，如果是莫拉克颱風的雨量，石岡壩應該撐不住。車籠埔斷層經過石岡壩，壩體底下的岩盤是破裂的，且水利署模擬的雨量是兩日，不是三天，事實上是低估了衝擊。
由於大甲溪的水利工程非常密集，最上游是德基水庫，往下有青山壩、谷關水庫、天輪壩、馬鞍壩到石岡壩，這些壩體猶如大型的攔砂壩攔阻砂石，張豐年就擔心發生連續潰壩的災難，在九二一地震後，每個壩體多少有問題，經過補強，尤其若是最上游的德基水庫潰壩，引起的骨牌效應，對下游居民將造成毀滅性的傷害。水利署表示，經濟部已經組成水庫安全評估小組，監控全台灣的水庫。
水是個環環相扣的複雜問題，中科一期、三期為大台中帶來繁榮、提供就業機會，卻也是用水大戶。為了台中地區的永續發展，水資源必須擬定承載上限，如果不斷從河川壓榨水資源，水反撲的力量，會是人們難以承受之重。
瀕臨嚴重滅絕危機、有「海上大熊貓」之稱的台灣白海豚面臨存亡關頭，在此同時，沿海工業開發仍未停下腳步。為保留白海豚重要的迴游棲地，環保團體正式展開彰化海岸國民信託活動，號召全民認股搶救白海豚。
