去年澎湖縣政府將馬糞海膽採捕期從2個半月縮短到2個月，7月1日才開放採捕，沒想到4日晚間，澎湖環保案件查察小組即在小白沙嶼海域等處查獲3起盜採案件，共沒入139顆馬糞海膽，還在漁船上發現約2公斤已去殼的海膽生殖腺。澎湖縣農漁局呼籲民眾勿以身試法，違法採捕殼徑小於8公分、在限制採捕期採捕，依《漁業法》可處3年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣15萬元以下罰金。
澎湖縣農漁局說明，由農漁局、警察局、海巡隊組成的環保案件查察小組，在小白沙嶼海域查獲漁船盜採79顆海膽、牛踏尾沿岸查獲60顆，警方已將漁船扣押，盜採海膽中的活個體則交給澎湖縣水產種苗繁殖場繼續養育，去殼的海膽生殖腺則冷凍保存作為物證。
澎湖縣除了馬糞海膽外，尚有黑海膽和紫海膽，不過這兩種海膽因為風味、生殖腺較小，以及棘刺較長不易處理，所以採捕狀況尚不如馬糞海膽頻繁，但去年因馬糞海膽數量較少，風味較好的紫海膽成為替代品，目前澎湖縣政府並未管制其他兩種海膽的採收期。為了減緩馬糞海膽的採捕量，澎湖縣政府去年將馬糞海膽採捕期縮短到2個月，原先採捕期為6月16日至8月31日，修正為7月1日至8月31日，並限制只能採捕殼徑8公分以上的海膽，不過，部分民眾希望縣府不僅限時間，也能進一步控管採捕總量，讓海膽能繁衍下一代。
對此觀點，農漁局表示，因澎湖採集海膽的區域很廣，且漁民不見得是透過漁會等固定通路銷售，因此連每年共採集了多少的海膽，縣府也沒有資料；另外，目前對澎湖海膽的族群總量和生態研究也還不齊全，因此現階段要推總量管制有難度。
澎湖縣目前有3處海域被列為海膽保護區：七美、小蠻及烏崁區域，其中烏崁地區是106年劃設，去年澎湖縣水產種苗繁殖場在此放流1萬5千顆以上的海膽種苗，希望可帶動此區域的海膽生態復育情況。
澎湖縣水產種苗場表示，自2008年就開始進行海膽繁殖試驗與放流的行動，隨著培育技術漸趨成熟，去年總計放流5萬4千多顆海膽種苗，放流的海膽種苗約2至4公分，因移動力強且生殖腺尚未發展成熟，不至於成為人類採捕的對象。近年水產種苗場已能年產上萬顆海膽苗，但因繁養殖的門檻較高，要由民間養殖海膽來降低野外採捕的壓力還有段距離，也還需要時間醞釀。
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