大鵬灣位於台灣西南沿海，屏東縣東港鎮與林邊鄉交界處，是台灣地區唯一囊狀潟湖地形。過去沿海居民設置了魚塭與蚵棚，水域幾乎被魚塭、蚵棚佔滿。1997年成立風景管理處，蚵架設備陸續拆除，魚塭則陸續填海改做建地。
2004年大鵬灣國際開發股份有限公司取得大鵬灣國家風景區建設BOT案特許經營權，開發面積超過257公頃，採分期開發建設，分為碼頭區、海灣區、高爾夫球區、生態區。環評要求高爾夫球場開發另送環評。
開發單位打算以填土方式進行，土方量高達232立方公尺，環評委員要求針對填土土方來源，過程對周邊的影響，及是否導致上游排水不良等問題做詳細評估。另外，農藥使用也得明確列出時間和種類，以免污染水域。
根據開發單位提供的資料，未來開發面積高達76公頃，包括67公頃的高爾夫球場與別墅區。為配合國家風景區低度開發要求，所有建築包括高爾夫球會館、訓練中心、別墅等建物的樓地板面積僅3萬5千平方公尺。
開發單位強調，過去高爾夫球場會有農藥與肥料污染問題，因此他們將以「有機農場」進行開發，減少農藥和肥料，長期監測放流水口的農藥殘留量，確保不影響鄰近水質。用水以自來水和雨水回收為主，絕不使用地下水。開發單位打算以填土墊高基地，所需土方大約232萬立方公尺，土方來原則以鄰近河川疏濬工程、土資廠等為主。
環評委員質疑，土方需求量如此大，卻沒有寫清楚土方來源，且填土工程是否會影響附近環境，後續恐引發問題。大鵬灣位於林邊溪下游，屏東縣政府正打算在上游處設置滯洪池以消減淹水問題，委員質疑，開發單位說大鵬灣沒有淹水問題，縣政府為何還要增設滯洪池；如果有淹水問題，下游以填土開發，是否影響上游排水，必須詳細說明。
大鵬灣地勢低窪，屏東縣環保局的代表表示，雖然開發單位最好明確詳列何時會使用農藥與肥料、使用何種農藥與肥料，並納入環評規範，否則一旦當地淹水，農藥肥料將污染海域。委員質疑，高爾夫球場的用水量相當高，單憑使用自來水與雨水回收如何支應，如果使用自來水恐導致成本上升，開發單位應仔細評估。最後主席凌永健決議補件再審，要求開發單位補齊詳細資料，讓委員評估開發對環境的影響。
