南科所在地的台南縣長選舉結果，現任縣長陳唐山蟬聯過關。雖然陳唐山在競選期間迴避濱南工業區開發案，只提爭取七股國際機場，且簽署「反高污染工廠進駐」的生態保育公約，讓產業界質疑他的選後施政可能出現大轉彎，「重環保輕經濟」，陳唐山11月30日在當選後嚴正聲明，未來4年不再受選舉影響，「會放手施政，且做應該做的事」，顯示陳唐山在七股的開發態度上一如過去，優先爭取七股國際機場，絕不會逐退東帝士與燁隆集團在濱南工業區的開發，但會嚴格為環保把關，寫下台灣經濟和環保並重「三合一」的地方開發新頁。
民進黨籍的台南縣長陳唐山4年前首次參選時，地方反對開發的環保團體在陳唐山上任的第1天，向陳請願，之後4年任期，陳唐山因為對濱南案不願意公開表態，成為環保團體抗爭和攻擊的對象。陳唐山在這次爭取連任時，在七股開票結果比對手得票數還要多，證明陳唐山在七股有相當程度的民意基礎。