針對尚未審核通過的基改成份，歐盟的政策在飼料上是允許其微量的存在，以避免進口飼料價格過高，但是在食品上則仍是規定零檢出；在2009年自美國進口的黃豆因若干貨櫃含有微量尚未核准的基改成份，因此整船都無法入港。現在歐盟準備放寬在食品上的規定，尚未核准基改成份含量若在0.1%門檻以下，將來也可能開放進口。不過德國農業與消費者保護部部長Ilse Aigner對此將加以反對，認為會危害到購買非基改食品者的權利。德國官方舉證表示，2011年歐洲法院也裁決蜂蜜中尚未核准的基改成份是零檢出。
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