6月10日，台南市環境保護聯盟按鈴控告交通部無視南鐵地下水報告問題，涉嫌偽造文書。翌日，台南單日累積雨量達137公釐，多處路段傳出淹水消息。正在熊本參訪的賴市長卻於臉書表示幾處傳統淹水地區未有災情，治水有成。
台南市環境保護聯盟6月10日前往台南地檢署按鈴控告。（照片由台灣水資源聯盟提供）。
不過，這陣急雨再度點出了一個爭議數年的問題——若地下軌道截斷地下水脈，導致鐵路東側的地下水位上升，目前規劃的排水設施是否還來得及在豪大雨甚至強颱威脅下，即時將雨水排出呢？
報告有誤交通部無作為 環盟按鈴控告
不過，2015年底台南環盟研讀這份地下水報告發現內容有誤後，召開記者會、工作坊，並前往台南市議會與市政府陳情，也在內政部都市計畫委員會專案小組會議中質疑報告可信度，但交通部只表示這份報告由「成大研究發展基金會」製作，沒有回覆報告是否經過專業審查和台南環盟提出的爭點。最後，台南環盟按鈴控告，期能喚起交通部重視。
台南市環境保護聯盟於今年5月5日前往台南市議會陳情。（照片由南鐵青年提供）
低估水位上升高度 鬧區安全恐受影響
首先，台南環盟認為應在鐵路沿線實際鑿井監測地下水，但這份報告只是根據遠處水井數值模擬評估。而且，和同期的成大論文相較，這份報告模擬出的最大上升與下降水位至少低估了40公分。
據台南環盟判斷，地下水流向主要還是由東往西，一旦被鐵路地下軌道截斷，東側的地下水位就會上升，西側則會下降。在最壞的情況下，這會導致東側淹水、提高土壤液化風險，而西側地層下陷、海水倒灌，影響範圍遍及東區、北區、仁德區甚至中西區等人口稠密的行政區。
因為1996年的環境影響評估與2010年的環境影響差異分析都沒有地下水位調查和因應對策，環盟認為，應該要再進行環境差異分析。
環盟發言人陳椒華教授表示，希望交通部能小心評估，也希望6月14日的都委會不要在資訊不完整的狀況下倉促決策。
台南市環境保護聯盟於今年5月5日前往台南市政府陳情。（照片由南鐵青年提供）。
