立院中相互辯論，地方上激烈抗爭，都因為國土計畫一延再延，形成許多爭議。
《國土計畫法》在2015年完成立法，經過漫長準備期，終於公告全國國土計畫，原訂2024年各地方縣市繳交國土功能分區圖，2025年4月公告實施。但是多個縣市以妨礙地方發展為由，拖延繳交，影響計畫期程，進入僵局。
國土計畫的功能包括規劃國土功能分區，規範土地使用方式，但是計畫延宕，已經產生政府加速開發、人民無法適用保障等問題。
鹿港富麗大鎮旁工業區 建議不宜開發仍通過環評
彰化鹿港富麗大鎮居民，抗議將在社區旁蓋起工業區。他們當初購置房屋，都是被這裡的清新環境所吸引。但是工業區一來，憂心帶來污染，居民相當無奈。
彰化環保聯盟專員吳慧君表示，此區域在全國國土計畫會議中，獲得土地不宜開發的建議，彰化縣政府進行環評審議時，並未參照建議，依舊通過環評進行開發，形成國土計畫全面實施前，地方政府不斷搶先開發土地的亂象。
莿桐部落林淑玲家園被認定違建 想增劃原保地遭否決
台東縣卑南鄉莿桐部落，一群人前來守護林淑玲的老家，這個他們世居的家園，被政府認定是違建，將要拆除。林淑玲過去曾參與反美麗灣抗爭行動，當初被撤銷環評的飯店，經過仲裁，由台東縣政府以六億元購回，即將委外營運。現在因為拆屋風波，又將大家聚集一起。
林淑玲的家園位於部落傳統領域，但是政府不承認是家族的土地，所以沒有合法建照，這幾年透過增劃編原住民保留地，希望取回土地所有權遭到否決。
荒野保護協會台東分會蘇雅婷展示一份規劃圖，表示拆除林淑玲老家的主因，是為了興建一條海岸步道。地球公民基金會副執行長黃靖庭認為，解決許多部落老屋不合法問題，除了劃設原保地，再來就是利用國土計畫來解套。守護團體呼籲，台東縣應盡速交出功能分區圖，並學習花蓮縣，以國土計畫功能分區的農業發展地區第四類，解決部落不合法老屋問題。
大家都想開發農地賺錢 國土秩序該如何管理？
許多縣市地區為了功能分區，爭執不斷，台南後壁農會總幹事林怡歆表示，台南後壁地區幾乎沒有爭議，自然而然劃入農業發展地區第一類和第二類。農地劃入農一進行保護，在地青農覺得有助保護景觀，發展農村觀光，但也憂慮，未來不做農，土地要如何使用。
台南許多農地成為科學園區，土地高度開發，地價不斷飆升，連帶影響其他鄉村思考，擔心國土計畫綁住土地發展。
為了解決國土計畫延宕問題，立法院召開公聽會，進行溝通討論。雲林縣民代表達，縣市劃設不公平，是延緩繳交功能分區表的原因。農業部強調，功能分區並非一成不變，每五年有重新檢討機制。
國土計畫爭議，也反映作農無望的心態，大家都想開發農地賺錢，解決問題的根源，在於創造農業的經濟與價值，不應該有劃設農一二，農地就被判死刑的心態。政治大學地政學系副教授戴秀雄表示，各縣市想開發農業區，獲得經濟利益，形成浮濫搶地問題，國土計畫就是要扭轉先搶先贏的心態，管理國土秩序。
國土計畫是國土秩序的框架，細部可以檢討修正，隨著變動成長管理。但是在各縣市仍有異議，各黨派相互爭議下，一拖再拖，不知何時才能完全上路。