行政院院會20日通過《莫拉克颱風災後重建條例》（草案）後，其中有關強制遷村、豁免適用環境法令、空白授權等條款，引起原住民、人權、社造與環保團體強烈抨擊。但政院未回應民意，昨（26）日提出的草案修正版，反而在原第12條強制遷村條款中，再增加「強制徵收原居地土地」文字，並在原14條增列「採砂石免申請」條款，撤守把關機制，替工程大開方便之門。
原住民族政策協會理事林淑雅表示，第12條增加強制徵收原居地土地的文字，意思就是，部落再也回不去原鄉。因為所有土地，包括已經由原住民取得所有權的保留地，或承租地，都將被強制徵收或終止契約。
綠黨發言人潘翰聲抨擊，一週來包含人權、環保、勞工、原民等公民團體與災民強烈抗議，行政院非但不思檢討，未能體察民意與社會觀感，反而軟土深掘、得寸進尺，於26日協商時提出更荒謬的黑金貪腐條文，綠黨予以嚴厲譴責。
他表示，「行政院之前救災無能，於災民尚未妥適安置，在此時提出重建條例與更倒退的增修條文，於災民傷口撒鹽、冷酷無情至極！」
潘翰聲批評，新版草案第14條第2項為「濫採砂石免申請條款」，第18條第1項根本為「比價議價綁椿」條款，兩項實為「貪腐黑金條文」，等於再度造成公共工程法、採購法、土石採取法等法制全面架空，而授權各級政府得以重建公共工程名義，免申請許可濫採砂石，以比價、獨家議價方式辦理採購，勢將使長期盤據地方黑金根源的濫採砂石、綁椿圍標工程、於重建條例三年內全面合法與加速鯨吞國產、形同司法的全面不設防。
他形容，此舉將造成「公共工程豆腐渣化」、「河川農地陸砂全面掏空化」，嚴重危害人民生命財產安全與國土復育的嚴重摧殘。
26日行政院版《莫拉克颱風災後重建條例》（草案）補充條文部份內容如下：
■ 第12條第3項
...依第一項災區被話定之特定區域，須限期強制遷居、遷村者：其所有土地及土地改良物得予徵收; 承租公有土地者得予終止契約，並依契約及相關法令予以補償。其無承租關係，在公有地上有實質居住、耕作者，得就其地上改良物酌收救助金。
■ 第14條之2
...各級政府機關興建或經其核准興建受災後臨時住宅、重建社區、重建災區交通、學校、及其他公共工程，採取所需砂石得準用土石採取法第3條第1項第4款規定。」（公共工程可免取得土石採取許可）
註：土石採取法第3條第1項第4款：採取土石，應依本法取得土石採取許可，但下列情形，不在此限：四.因天災事變緊急搶修公共工程所需者。
■ 第18條第1項
...各級政府辦理災後緊急重建工程之技術服務及工程採購，得以議價或比價方式辦理」 （由20日版最有利標改為比價議價）。
