天然林保護工程的實施，實現了東北、內蒙古重點國有林區由過度消耗向恢復性增長轉變。實施天然林保護一期工程以來，東北、內蒙古地區森林面積淨增2421萬畝，森林覆蓋率增加4.1個百分點，森林蓄積淨增2.73億立方米。
東北、內蒙古重點國有林區是中國重要的天然生態屏障和木材資源戰略儲備基地，也是中國天然林集中連片面積最大的林區，林區總經營面積達3274.12萬公頃，佔國土面積的3.4%，森林面積2564.01萬公頃，佔全國森林總面積的13.11%。
東北、內蒙古國有林區嚴抓採伐管理，有效遏制超限採伐、無証採伐等違規行為，森林資源實現面積、蓄積雙增長，明顯改善了區域生態狀況。
「十二五」期間，中國將重點實施天然林保護二期工程和大小興安嶺生態功能區經濟轉型規劃。天保工程二期如順利實施，東北、內蒙古重點國有林區等重點天保工程區可增加森林面積900萬畝，增加森林蓄積2.9億立方米，增加森林碳匯1.09億噸。