繼5月25日放射性廢棄物管理政策評估專案小組第一次會議，28日再召開第二次專案小組會議，針對核廢料處理原則進行討論。與會民眾除了抗議程序問題，並當著主席邱文彥面前陳情，要求邱文彥擔任立委之後能積極修法讓當地人民的生活免於恐懼。會議因未能讓與會委員充分表達意見，將再召開延續會議。
會議之前，來自核一、二廠所在地的金山、貢寮等地的居民，也在環保署大門口召開記者會，認為核廢料政策環評說明書和相關政策文件只能用「千瘡百孔，荒謬無解」形容，要求在台電與原能會都無能妥善處理核廢料的狀況下，核電機組應盡速停機。
台灣環境保護聯盟秘書長李卓翰發言時先提程序問題，確認民眾發言的意見以及歷次會議紀錄載明要求原能會改善之意見，原能會未履行之原因；他說，政策環評對於環境有沒有影響應該要有社會科學的研究方法，而非只是「當地社會、生態無影響」這樣的說法。堅持原能會應確實達到會議要求的條件，才能召開會議。過程一度僵持不下，經溝通，主席同意未來原能會回覆意見也徵詢民間團體的意見。
對於原能會將境外處理列為用過核廢料最終處置方式，綠色公民行動陣線洪申翰表示不可能，核廢料境外處理並無前例，「境外再處理」的目的是要將用過燃料棒中的鈾和鈽回收再利用，還是得將更不穩定的高階核廢料運回國內貯存。「經濟部的說法根本是意圖欺瞞國人，讓社會誤以為將高階核廢料運至境外就會消失！」
洪申翰也指出，冷卻池太密集了，台電卻在核一核二廠大量密集化，將此過渡性做法，轉變成常態，政策環評書上也隻字未提。如此「密集化」作法，在1996年核二廠乾式貯存廠環評說明書評定為「技術尚未成熟，不可行」，然而台電卻在未經環評的情況下，一再施作越放越密，恐造成安全疑慮。
綠黨中執委王鐘銘表示，「力行減量」是四項放射性廢棄物管理指導策略之一，目標是抑低產生量，在評估說明書中，相關方案只有「減容處理」，未將核一二三停機、核四停工，直接從源頭減少產生量納入考量。
來自金山、貢寮區居民紛紛指出原能會的環說書不切實際，「紙上談兵，拿民眾的生命開玩笑」。鹽寮反核自救會會長吳文樟即說，若如原能會所言都沒問題，那麼政府辦公室都搬到核電廠附近，讓大家心服口服。貢寮居民楊貴英表示，東北角既然為觀光保護區，為何容許高污染產業進入，主張「以用電比例分攤核廢料」。核電建廠就應考慮核廢料最終處置，而不是像蓋完房子，卻跟別人借廁所一樣。居民楊木火則針對《放射性物料管理法施行細則》第37條，要求台電將每4年應修正檢討用過核廢料之處置修為2年。
環委也對於環說書放射廢棄物之管理總目標、境外處理之可行性、貯存廢棄物之走向語焉不詳表示不妥，要求具體說明。
民眾提議下次會議到核二廠召開，但主席認為沒有前例、勞師動眾，不同意。對於民眾表示福隆沙灘退縮很嚴重，觀光資源都受影響，邱文彥除了表示尊重，也要求原能會針對海岸變遷進行影響分析。
