巴西的主要財富來源是農業經濟，佔國內生產值的37％，創造37％的工作機會，並佔今年上半年出口總值的35％。但是，巴西國家審計院的報告卻指出巴西的衛生防疫系統呈現嚴重缺失，這些缺失除了影響生產衛生，還可令巴西的外貿蒙受損失。8月中旬，巴西中部南馬度格洛索州就因出現新的疑似口蹄疫區，令畜牧業主再度受驚。而這一次，也懷疑生病的牛隻係來自巴拉圭。南馬度州衛生防疫管理廳長卡法雷洛甚至指巴拉圭是「口蹄疫出口國」，無視國內出現的牲畜疾病。
國家審計院指出的缺失包括欠缺稽查港口、機場和邊界的人手。農業部本身也承認，邊界稽查範圍欠缺340名聯邦稽查員、170名技術人員和120名行政管理人員。除此之外，港口和機場也缺乏化驗室和有機垃圾焚化爐。