東海大學、中研院及農業部合作的最新一項研究發現，澎湖南方四島三種珊瑚礁經濟魚類，從幼苗到成魚會出現「搬家」行為，從淺水近岸藻類棲地遷移到結構較複雜的珊瑚礁。團隊建議建立空間明確的保育規劃，整合育幼與成魚棲地熱點，並以兩層級作分區管理，劃設嚴格禁漁區與棲地保護區，確保漁業資源永續。研究成果也於昨（16）日刊登在國際期刊《Pacific Conservation Biology》。
三種經濟魚類平均密度減半
本研究由東海大學、中研院、農業部水產試驗所共同進行，成果刊登在國際期刊《Pacific Conservation Biology》。研究學者之一、東海大學生命科學系教授溫國彰昨（16）日與SMC台灣科技媒體中心、海洋國家公園管理處等單位，舉行線上記者會發布成果。
研究團隊透過公民科學蒐集社群媒體裡的釣獲資料，識別三種在澎湖南面海域主要捕獲的經濟魚種——石斑魚科（Epinephelidae）、鸚哥魚科（Scarinae）、笛鯛科（Lutjanidae），並於2013年及2015年夏季，於澎湖南方四島國家公園40個地點，在50公尺ｘ5公尺穿越線、水深8～10公尺範圍進行水下攝影機視訊調查，發現目標物種族群數量平均密度，從每平方公尺有0.14條，大幅下降至0.07條。
團隊進一步研究上述三種目標物種的幼魚與成魚棲地選擇，結合衛星遙測底棲生物分布圖作差異分析，發現目標物種的幼魚與亞成魚／成魚會進行棲地遷移。幼魚占據近岸藻類棲地的機率較高；成魚則會遷往結構較複雜的珊瑚棲地，或地形坡度較陡、特定底質的區域。
棲地分布
幼魚
亞成魚／成魚
石斑魚科
集中在東嶼坪嶼和西吉嶼
似乎向西嶼坪嶼和東吉嶼轉移
鸚哥魚科
占據隱蔽的礁石區，特別是西嶼坪嶼與東嶼坪嶼之間，及西吉嶼東側
擴展到四個島嶼的礁石上
笛鯛科
少量在西嶼坪嶼南岸
較常見於東嶼坪嶼南岸和東吉嶼北岸
棲地偏好
幼魚
亞成魚／成魚
石斑魚科
70%藻類和30%非生物基質（沙／岩）
似乎轉向結構更複雜的珊瑚棲息地，如葉狀珊瑚、殼狀珊瑚、次塊狀珊瑚和死枝狀珊瑚
鸚哥魚科
喜歡各種形態的珊瑚和藻類，以及沙／岩
只有藻類棲息地比例隨生長而下降，葉狀珊瑚棲息地比例則上升
笛鯛科
僅利用藻類棲息地
逐漸過渡到利用沙子和殼狀珊瑚棲息地，也表現出對沙的強烈偏好
棲地遷移也意味著，只保護成魚棲息的珊瑚礁並不足夠，要有效維護族群永續，必須同時納入幼魚依賴的藻類棲地。團隊建議整合育幼與成魚棲地熱點，設雙層分區管理策略，包括在不同生命階段的豐度熱點區域設嚴格禁捕區，其周邊區域則設棲息地保護區。溫國彰補充，亦應設最小捕撈尺寸及限額等補充管理措施，且只允許非破壞性捕撈。
劃設保護區需長期科研 學者與公部門缺經費
溫國彰曾於2023、2024年重返南方四島國家公園，當時他申請到另一個部門的經費，以更精準的目視方式進行調查，發現目標物種密度回升至每平方公尺0.08～0.12條，石斑魚仍然稀少。由於前後調查方式不一，目視記錄的魚類偵測率比攝影機高1～4倍，尚須長期監測研究才能 可進行分析推論，不過海洋科學研究經費龐大，兩個調查相隔十年，顯見相當不易。
海洋國家公園管理處保育研究科技士吳岱穎則回應稱，國家公園經費「非常非常有限」，從南方四島國家公園2014年成立至去（2025）年，約投入8500萬經費進行50個研究案，「以海洋科學研究來說很少」，當新興海洋議題出現如清除棘冠海星，也會導致支持基本研究的資源減少。他承認，過往沒有相關經濟魚類遷移的研究，故「不知道」要對育苗區進行保護措施。
現有科研結果作根據，是否就有機會劃設雙層保護區？溫國彰稱，國家公園經營不只看生態調查，以墾丁國家公園為例，一直有地區漁民與休閒釣魚需求的壓力，後來公部門設《一般管制區垂釣許可管理要點》，民眾向墾管處申請垂釣認同卡方可進行垂釣活動，但條文裡並無規定要回報魚獲數量、大小。
吳岱穎則認為，南方四島國家公園擴大保護區、禁漁區的建議是可行，「接下來就是民眾溝通的部分。」
澎湖南方四島國家公園面積約3萬5500公頃，包括一般保護區、海洋生態保護區、特別風景區和水上休閒區。
一般保護區按國家公園計畫規定，允許傳統季節洄游性漁業活動，但嚴禁使用破壞性漁法，例如毒餌捕魚、電魚、炸魚、底拖網等；民眾一般休閒釣魚活動則全面禁止。生態保護區則是鐵砧嶼周邊的嚴格禁漁區，但只占南方四島國家公園整體面積3%。如違反規定，最高罰鍰3000元。
至於這類季節性捕撈，吳岱穎稱主管機關應屬農業部漁業署，故國家公園署無法規範捕撈數量或大小。假設之後按《國家公園法》劃設相關保護區，此前的捕撈許可會廢除，並按照新保護區條文作管理。