原本綠樹成蔭、綠意盎然的松山菸廠，堪稱台北都心少有的都會森林綠帶。為了開發大巨蛋，環評未過，老樹就被移植至寶湖國中預定地。但松菸公園催生聯盟29日實地勘查發現，移植後樹木枯死高達107棵，寶湖國中預定地儼然成為了樹木墳場，環保團體要求台北市市長郝龍斌為枯死的樹木負責。
松山菸廠的老樹移植工程向來爭議不斷，松菸公園催生聯盟認為大巨蛋開發案環評必須重作，在尚未通過前，不應移植松山菸廠老樹，但市府為在簽約後一年內交地，反而督促包商加緊移樹。開發單位並在7月4日樹木保護委員會上表示，移植狀況良好，也在9月3日第60次環評大會表示：「松山菸廠移植寶湖國中的384株樹木皆存活」。
然而，松菸公園催生聯盟在現場的勘查發現，5棵已經死亡的白千層，3棵森氏紅淡比中死了兩棵，大葉桉也是死的比活的多，其他包括黃心柿、山櫻花、肯氏蒲桃、樟樹、楓香、阿勃勒等等，逐一清點後，已經枯死的樹木達107棵，比公園路燈管理處自行統計的47棵高出許多。
光復國小家長游藝指出，樹木是維繫人類生命的重要元素，沒有樹木，下一代的孩子也將失去未來。要求郝龍斌不要再拿環保作秀，環保並不只是種種小樹、騎騎單車。樹會枯死，是因為人謀不臧，因為台北市長假環保、護航財團。
松菸老樹成片枯死，再度證實老樹移植的存活率極低。台北市樹木保護自治條例第六條明定，公有土地上的受保護樹木以原地保留為原則，但實際上樹木保護委員卻有「移走比留下多」的無奈。樹木保護委員會對於大巨蛋開發案，雖提出增加原地保留樹木的折衷方案，但遠雄全區開挖的規劃案仍未改變，日前在都市設計審議會上拒絕了樹保委員會的提議。
大巨蛋距離南京敦北小巨蛋僅不到2公里，市府在2005年底提出的規劃報告書當中也指出，頂好商圈和信義計畫區環繞下，「市場重疊性高且競爭激烈…整體考量方面，不宜太過於審慎樂觀」。松菸公園催生聯盟認為，松菸大巨蛋週邊「附屬」百貨公司、購物商場、辦公大樓、國際觀光旅館，顯然無開發的必要性。
綠黨秘書長潘翰聲表示，郝龍斌欺騙媒體說，松山菸廠樹木移植工程並未違反相關規定，一切依法行政，而9月5日環保局對台北市政府教育局違反92年環評審查結論，以及未依環評法規定召開施工前公開說明會，開出兩張各30萬元的罰單，證實郝龍斌是個「假環保」的「說謊市長」，並認為罰單應該由郝龍斌自行買單。
