農委會補助花博高達35.27億元，結果出現嚴重預算排擠，農委會日前調高公糧稻穀收購價，一年將增加支出6億元經費，但是卻找不出錢，不但被迫動用到行政院的第二預備金，又造成米價上漲，民眾的納稅錢不但被用來收購公糧，自己還得多花錢買米，等於被剝了兩層皮。
農委會今年預算956億元，第一預備金4千多萬元，第二預備金則是行政院因應緊急狀況的救命錢，今年大約編列了80億元，調高公糧收購價格所支付的6億元，就佔了將近7.5％，萬一國家再有緊急開支，財政必將更加困窘。
、24日馬英九總統宣布提高公糧收購價，推翻3天前農委會主委不願調整收購價的說法，農委會26日正式調高價格3元，不但政府得再增加6億元支出，更造成稻穀全國平均價格從每公斤20.6元漲至23.76元，漲幅15.3％；白米零售價也應聲上漲，從36.95元漲至38.65元，漲幅近5％。
開南大學行銷系榮譽講座教授吳明敏指出，農委會花了超過35億元補助花博，現已出現嚴重預算排擠，不僅吉園圃、有機農業的預算今年比去年減少6成5，產銷履歷也只剩下1千萬元，比去年減少3成7。連調高公糧收購價增加的6億元經費，都要由第二預備金支出。花博花了中央政府很多錢，相關的商品和門票收入全歸台北市政府所有，要台北市政府幫忙農民，甚至付這6億元也不為過。
台北花博發言人馬千惠回應，花博的產值是由全民共享，創造出的經濟效益也是全台灣共同創造，並非由北市府獨享。
中興大學應用經濟系特聘教授陳吉仲說，雖然增加的米價佔國人平均飲食消費支出並不多，但是高糧價對中低收入戶的影響卻相當大。
陳吉仲表示，多數農民沒有烘穀設備，只把濕穀以輔導收購價格將權利賣給糧商，糧商烘成乾穀後，再以更好的計畫收購價格賣到公糧倉庫，從中賺取價差。若直接補貼給農民，可以吸收種稻上漲的成本，後端價格也不會連帶上漲。
苗栗苑裡農民陳文龍與崑濱伯都認為，除了提高收購價，更應提高收購量才能真正增加農民收益。如果農委會35億的花博補助款用來增加公糧收購，以每公斤26元收購價格計算，可增加約13.5萬公噸的公糧，等於比現行收購量20萬公噸，再增加近7成的量；即使把花博補助款直接補助稻農，也可讓全台22萬7千戶稻農每年再多約1.5萬元收入。
農糧署副署長游勝鋒表示，花博預算是分年編列，而公糧收購動用第二預備金，是因為今年預算已經編列，對於額外增加的支出，才會動用第二預備金。
