淡水河匯集大漢溪、景美溪、新店溪以及基隆河等主要支流，河系總長324公里，根據台北市環保局監控資料顯示，影響淡水河水質主因上游端受大漢溪及新店溪水的水質來決定。為達台北市長郝龍斌允諾的淡水河4年清水目標，台北市政府各相關單位都將整治工作列為明年度的重點業務，台北市工務局衛生下水道工程處指出，明年迪化汙水處理廠正式運轉後，汙染情形可望有所改善，不過因主要汙染源都來自北縣，截流或接管率能否成長，將大大左右整治成績。

台北市環保局長沈世宏指出，淡水河本流汙染指數從88年以來都是重度汙染，汙染源以家戶汙水為主，若以縣市做區分，北市汙染貢獻量比例為12.8%，其他87.2%都來自北縣；而北縣排汙量大主要因為汙水下水道接管率低，目前普及率僅8.9%，遠不及北市。