台東林區管理處配合林務局的「國家步道系統建置計畫」，建置全國登山健行步道網，其中利嘉林道也在規劃中，台東縣利嘉林道發展協會和保育團體持不同的看法，建議重新評估調查利嘉步道生態環境。

台東林管處則表示，林管處肩負維護山林生態的責任，所有的工程，都會依原有的步道，根據自然生態特性，在最小範圍內施工，不會輕易破壞生態或物種棲地，目前相關案件仍在評估，生態維護將是最重要指導原則。

惟利嘉林道海拔400公尺到1200公尺間區域，行政院農委會已於89年10月公告為「野生動物重要棲息環境」，嚴禁任何破壞野生動植物及自然景觀的行為。而台東林管處整建計畫範圍，在海拔830公尺至1050公尺間，位在「野生動物重要棲息環境」內，顯然違反保護野生動物棲地的初衷。

利嘉林道是學術、保育單位生態、物種調查重點區域，其中保育鳥類藍腹鷴族群穩定生長；全國各野生動物學術研究單位，也都設置調查樣區，研究台灣特有的兩棲蛙類橙腹樹蛙特殊的生態、繁殖行為，但如今步道預定路線，直接侵入物種繁殖核心區域，嚴重侵擾野生動物。