一項由綠色和平組織秘密進行的調查，證實捕鯨船「日新丸號（Nisshin Maru）」的船員涉嫌走私鯨魚肉，這些船員將日本南極捕獵行動中所捕獲到的優質鯨肉，偽裝成私人行李走私到陸地上之後，再透過貿易商進行非法交易。

經密告人士指出，經營日新丸號的「共同船舶（Kyodo Senpaku）」捕鯨公司高階船員和官員，放任這樣的走私行為已長達十多年。

澳洲海關2月11日公佈二隻死亡的鯨魚被拖上日本捕鯨船的照片，澳洲政府表示這些影像將可支持反對日本捕鯨的法律行動。

澳洲海關「海洋維京號」正在監測日本捕鯨船隊在其附近海域的行為，澳洲政府表示他們將延長監看日本的捕鯨行為。面對此事件，檢察長還在思考應該採取何種法律行為，以及以誰為對象。

歷經2月日籍捕鯨船日新丸號在南極發生的火災意外後， 日本政府與京都船舶（Senpaku）公司支持的日本鯨類研究所（ICR）28日發出聲明，表示2006與2007年間的南半球夏季漁季將縮減。京都船舶公司利用鯨類研究所的船隻，來運作它的捕鯨計畫，這一季預定的獵捕配額為935隻小鬚鯨和10隻瀕臨絕種的長鬚鯨，日新丸號自2006年11月出航後已捕捉505隻小鬚鯨和3隻瀕臨絕種的長鬚鯨。日本漁業官員Takahide Naruko表示，「我們不認為這對鯨魚肉價會有太大影響。」

日本捕鯨船日新丸號10天前發生火災，導致船隻嚴重受損以及一名船員罹難，25日該船從羅斯海域再次啟航。日新丸號是日本鯨類研究所捕鯨船隊的補給船隻，該組織總部位於東京，與日本政府關係密切，而日新丸號此次的航行由捕鯨船隊中另外兩艘船艦陪同，朝北部前進。