澎湖青灣珊瑚產卵重鎮，也抵不過此波寒害侵襲，生長在水深二至二點五米的鹿角珊瑚全數白化死亡，但其他珊瑚物種包括波形靈芝、雀屏、腦紋、軸孔、微孔及菊珊瑚等，則未受影響，同時海底雖然魚屍眾多，但也看得見活魚覓食，顯示生態尚未破壞殆盡。

由於澎湖發生百年最大寒害，造成沿岸魚群（包括養殖魚類）死傷慘重，澎湖海洋生物研究中心研究員謝恆毅，日前冒著低溫下海勘查，在青灣內海發現海底魚類雖然也是死傷慘重，每平方公尺都有一至二隻青麟魚死亡，其他臭肚魚、隆頭魚及橫鱠紋魚魚種都有死亡，但相對也發現二十五公分大型石斑、刺河豚、老鼠斑活力很好，打破澎湖已是死海的說法。