因開發過度、利用過度、污染過度，長江的水域生態環境受到破壞，長江水生生物鏈中上、中、下端的各物種資源正處於全面衰退之中。

日前，在貴陽召開的首屆赤水河流域發展與保護高峰論壇上，長江漁業資源管理委員會專家趙依民說，長江作為生物基因的寶庫，水生生物資源正呈現出急劇衰減的趨勢，不少物種瀕臨滅絕。其中白鱀豚處於極度瀕危狀態﹔白鱘已經難覓其蹤跡﹔聞名遐邇的長江鰣魚更是絕跡多年﹔水中活化石中華鱘數量也急劇下降，並有繼續減少的趨勢﹔許多種類的魚苗量也自2003年開始銳減，2004年至2006年的平均魚苗發生量僅為2003年前的10％。

政務院2月14日批准並印發了《中國水生生物資源養護行動綱要》。《綱要》明確規定，要完善工程建設項目環境影響評價制度，建立工程建設項目資源與生態補償機制，減少工程建設的負面影響，確保遭受破壞的資源和生態得到相應補償和修復。對水利水電、圍墾、海洋海岸工程，海洋部門在批准或核準相關環境影響報告書之前，應徵求漁業行政主管部門意見；對水生生物資源及水域生態環境造成破壞的，建設單位應當按照有關法律規定，製訂補償方案或補救措施，並落實補償項目和資金。