位於台北近郊的「關渡自然保留區」，原為保留棲地維繫鳥類多樣性，卻因嚴格限制人為介入，少了經營管理而逐漸陸化；棲地型態的改變，更直接衝擊鳥類多樣性。農委會於10月5日召開的「農委會自然地景及自然紀念物審議會」，通過台北市政府提案廢止關渡自然保留區，20日正式公告，終結35年來禁止人為經營的法令。台北市政府表示，未來將依《濕地保育法》所指認的「國家重要濕地」進行管理。
審議會中，台北市政府提案的「廢止『關渡自然保留區』之指定」獲得八成以上出席委員同意。從此，「關渡自然保留區」將讓位給「關渡重要濕地」。
紅樹林擴張反讓鳥種下降 關渡自然保留區讓位給重要濕地
依據「陸域自然地景與自然紀念物指定及廢止審查辦法」第8條規定，自然地景、自然紀念物之廢止條件包括「保護之功能與效用，已有其他保育措施或其他法定保護區域得以替代」。
「關渡自然保留區」位於台北關渡平原西南側，接近基隆河與淡水河的匯流處，早期主要由茳芏（音同「江土」）、蘆葦及大面積的泥質灘地所組成，每年候鳥遷移季節時，吸引上萬水鳥於此停棲或度冬，為候鳥重要棲地，農委會於1986年依《文化資產保存法》會銜經濟部公告劃設，範圍為關渡堤防外55公頃沼澤區，保育標的為水鳥，並指定台北市政府府建設局（現之產業發展局）為管理機關。
依文資法第86條第1項規定，自然保留區內「禁止改變或破壞其原有自然狀態」，完全禁止人為經營管理手段介入，僅任其自然演替。
2010年北市府動物保護處成立後接管此項業務。只是，在長期自然演替下，關渡自然保留區紅樹林持續擴張。動保處指出，接管後透過保護區域及其周邊環境長期監測，發現因爲紅樹林快速擴張，保留區由原本的泥灘逐漸演變成一半以上範圍皆為紅樹林的處境，使得水域性鳥類利用不易，鳥種從原監測至最多130種以上下降至48種，並以樹棲鳥類為主，顯然違背當初設立自然保留區的目的。
另，台北市政府經水工模型推演，認為紅樹林擴張造成基隆河朝向深槽化發展，可能掏蝕基隆河左岸的社子島堤防；若林下漂浮木過度堆積，更可能阻斷通水，造成水位抬升，形成洪患隱憂。北市府考量該區已有《濕地保育法》及《水利法》共同保護，而提案廢止自然保留區。
北市動保處長宋念潔表示，濕地法允許適度地進行棲地經營管理，將有助於當地自然環境的改善。北市府已擬定相關經營管理計畫，未來將與中央主管機關合作，就調節紅樹林生長以達到回復水鳥棲地、降低洪犯威脅等面向，訂定保育利用計畫，並持續執行監測。
而針對民眾與生態團體擔憂保留區廢止後將面臨開發衝擊，動保處說明，廢止後原保留區全區目前仍屬於關渡重要濕地的核心保育區，僅允許生態保育及研究利用，民眾無須擔憂。
台北鳥會：紅樹林移除需持之以恆 河川清淤更有效
1980年代，台北市野鳥學會是積極倡議關渡自然保留區劃設的民間團體，也見證紅樹林擴張，卻受限法令，無法適度人為介入管理的窘境，多年來積極倡議縮編保護區範圍或文資法修法。此次為了增加鳥類多樣性公告解編，北鳥總幹事陳仕泓認為，若只是去除紅樹林意義不大，應從河川淤積的根本問題解決，務實的解決問題。
雖然理論上廢止沒錯，但是否採全面解編，台北鳥會主張，縮編保留區範圍就可以了。「紅樹林或許對水鳥利用範圍不夠，但畢竟仍具生態系價值、提供營養源，並為底棲生物、魚蝦貝類附著帶來幫助。」
陳仕泓表示，關渡是基隆河的沖積扇，淡水河沿岸，由於洪泛平原開發以及建堤防，限制河川走向與通道，使得河道不斷淤積，淤積的土方讓紅樹林長得好，間接造成水鳥種類及族群數量下降。
另外，台北鳥會建議，不要期待一次性疏伐紅樹林就能成功，除了經費驚人，也需考慮增加通洪斷面增加水鳥棲息環境；清淤高度最好降到水鳥可以利用的位置，採取漸進式疏伐，從外緣往內逐步清除，最重要的是持續管理，否則幾年後紅樹林又會長回來，之前的努力變得「無採工」。
