經濟部水利署規畫在屏東縣春日鄉興建士文水庫，2009年10月環評審查時被要求進入二階環評，5日在環保署完成範籌界定會議（界定二階環評應評估項目）。水利署預估明年3月可完成調查，6月送二階環評書開始審查。
不過蓋水庫的爭議一直都很大，台灣能蓋水庫的地方幾乎都已蓋滿，對水資源的掠奪毫無節制，連不適當的地點都被選為水庫壩址。
國家重大建設由誰定義？
例如士文水庫，一階環評時被認定對環境有重大影響之虞應進入二階環評，原因之一就是，選定的場址依南部區域計畫第一次通盤檢討已被畫為「限制發展地區」，不允許作為非保育目的的開發。
但這個規定排除「國防與國家重大建設」，水利署指出行政院4月6日核定「台灣南部區域水資源經理基本計畫」，士文水庫已被列為重大公共建設計畫。不過所謂「國家重大建設」是否應由行政部門片面定義，過去民間已提出許多質疑，水利署能否依此突破限制區規定，恐怕還有爭議。
士文水庫位於潮洲斷層，中央地調所已歸類為存疑性活動斷層。
屏東人口會成長？每人用水會增加？
另外水利署提出興建士文水庫的理由是，到120年，屏東縣人口再成長1.61萬人，每人每日生活用水量也多4公升，因此全縣用水將達到24.1萬噸。而目前公共給水每天16萬噸，其中8萬由牡丹水庫供應、其餘抽地下水，導致地層下陷，興建水庫每天可供水20萬噸，可提高自來水普及率從24.67%到68.34%。
不過屏東農田水利會質疑，屏東根本不需要自來水，人口也沒成長，沒必要為了蓋水庫而蓋水庫，否則對環境影響很大。屏東縣長機要秘書鄭文山也認為，目前都在強調節水，這種水資源成長的預估方式有待商榷。
農民擔心水庫興建後影響灌溉、養殖用水
屏東農田水利會枋寮工作站副管理師尹吉城表示，內溪圳引士文溪水灌溉，這裏的灌溉面積有465公頃，每天用水量1.213cms，士文水庫蓋起來後就沒水可用，在農業用水未獲保障前，反對興建士文水庫。
屏東縣長機要秘書鄭文山也說，這裡不只有灌區，還有養殖區，應先了解這些地區的用水需求、如何分配，而且一定要盡量滿足當地需求。
水利署水源經營組簡任正工程司簡振源強調，士文水庫的供水以公共用水為主，沒水權的無法考量供水。至於養殖及農業用水有其他方案考量。
士文水庫位於原住民保留區，居民擔心土地徵收後的生計問題，希望能以地易地繼續保有耕地。而壩高103公尺，對流域水文、河川輸砂有不利影響。
另外士文水庫滿水位標高170公尺，水庫淹沒區內155到158公尺間發現Magalakan遺址，本次水利署提出替代方案，如要原地保留遺址，滿水位標高需降到145公尺，供水能力因此減少8.5萬噸，必須推動節水或由海水淡化供應。不過水利署強調，替代方案只會是不得已的選項。
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