台北信義計畫區有意引進日系磁浮系統，但捷運木柵線噪音、站體過大等問題，使得民眾對磁浮捷運存有電磁波傷害、噪音等先入為主的負面印象，更擔心台北成為外國磁浮捷運的「實驗場」。借鏡日本浮磁捷運（HSST）營運經驗，艾思博捷運公司表示，愛知磁浮建設期間，日本國內有關手機電磁波的話題正延燒，居民對磁浮電磁波的安全確實多所疑慮。
由愛知縣、名古屋市和營運單位共同執行的「環境評估作業」加入電磁場評估一項，在沿線路線構造相異的5處，分別於實驗階段、正式營運前和營運後3個月，測量電磁波，結果均比「國際非電離放射線防護委員會（ICNILP）」的容許範圍標準低很多，營運後的實測值也比當初預測值下降，幾乎接近關閉的磁場。