近年海洋污染議題備受關注，不只是陸上垃圾會進入海洋，漁業廢棄物也會隨著洋流造訪鄰國，9日立法院內政委員會中，就有委員針對中國廢棄物隨海流進入金門境內一事，要求海委會應協助地方政府與中方協商處理辦法。海洋委員會表示，海廢議題不只是單一區域的問題，需要不同國家攜手解決，過去在亞太經濟合作會議（APEC）中就有與中國、印尼等國家共同討論，近期中國將辦理海洋廢棄物的工作坊，會把台灣的情況帶過去討論。
海洋委員會9日協同旗下海洋保育署、海巡署及海洋研究院等單位到立法院進行業務報告，立委黃昭順質詢指出，金門縣沿海深受到中國漂流物所害，過去環保署都會協助金門縣政府與中方協調海洋廢棄物處理事宜，質疑海委會接手業務後並未積極協助地方政府。海委會主任委員李仲威回應，並沒有把處理海廢的責任全部交給地方政府，海委會已投入經費補助地方政府清理覆網等淨海措施，在跨國合作上，如APEC漁業工作小組會議，也積極與中方協調處理垃圾。
另外，立委鄭秀玲也對海委會處理海廢工作進程表達關心，日、韓等國都已制定法規處理海洋廢棄物，部分垃圾的回收處理率甚至可達8成以上，但台灣連監測機制、海岸污染標準都沒有，垃圾回收處理的進程似乎也較其他國家慢。對此，李仲威回應，海委會除了守護海域安全，另一項重要的任務就是維護海洋生態，在海漂垃圾的處理上，等海洋基本法草案通過後，會在子法《海洋保育法》、《海洋污染防治法》中具體規定工作事項，也會積極與環保署、民間團體等單位合作辦理。
李仲威補充，其實國內企業有將廢棄漁網再利用的技術，不過國內廢棄漁網量並不足以支持企業為此開闢生產線，「開了生產線，可能3個月就沒有料，如何穩定物料來源是再利用的重點。」因此，海委會也考慮在APEC等跨國會議的工作小組中，與東南亞國家合作解決漁業廢棄物問題，可運回國內一起處理，以改善有技術、卻沒有物料的困境。
針對台灣海岸受到中國海漂垃圾侵擾問題，海洋保育署署長黃向文會後受訪表示，海洋廢棄物已經是國際公認的重要議題，台灣的海廢也並非只有來自中國，這個議題只靠一個國家是沒辦法處理的，需要仰賴跨國合作，像是韓國近期就召開海洋廢棄物的國際工作坊，年底中國也有海洋廢棄物的工作坊，屆時會把台灣的情況帶過去討論。
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