台灣在積極發展對外經貿關係之外，該如何兼顧環保與在地農業？有學者認為可仿WTO將環境保護條款納入ECFA(兩岸經濟合作架構協議)，以保護台灣消費者；其次，應為台灣農產品建立品種保護，以保護台灣研發的種苗避免他人盜用。
由兩岸協議監督聯盟所舉辦的「從ECFA談貿易對環境與農業的衝擊」座談會，於日前(28日)邀請清華大學教授彭明輝、交大科技法律研究所副教授倪貴榮、中央大學通識中心教授李河清等學者與談ECFA簽訂之後相關重要議題。
倪貴榮表示，國際上有許多貿易自由化與環境保護是否衝突、或能否相輔相成的爭論，不見得有定論；但實際去看，貿易自由化也能對環境有正面影響，例如高經濟發展國家可將新的低污染生產技術導入其他貿易夥伴，另外在貿易往來中建立環境保護條款，能透過貿易制裁，來抑制貿易輸出國破壞生態的行為。
從WTO貿易條例中，有對不合格產品的抵制條例，如TREMs環境措施(Trade-related Environmental Measures)，甚至有貿易制裁措施(Environmental
Trade Sanction)，對某些國家觸犯環境條例會給予制裁。針對倪貴榮報告的內容，來賓提出疑問：「以台灣為例如果對岸所產製的不良產品，要如何在ECFA的條文中拒絕甚至制裁如此的黑心商品？」彭明輝認為，若參考國外經驗，台灣應該積極設立民間的檢驗機構，建立一個產品進入台灣市場的關卡，對於標誌不明且內含物不清楚的產品必須限制於外。
至於台灣該如何將環境保護條例放入ECFA條例，李河清認為可參考WTO的相關環境保護條例直接置入ECFA的附案中。另外，如果雙邊貿易產生紛爭，ECFA條文有爭端解決機制，也就是兩岸經濟委員會來解決相關貿易問題，輸的一方可提請至WTO進行裁決，但前提是WTO需認可ECFA。而WTO為多邊自由貿易組織，其條例所訂定的內容對會員國家具有相同的約束力，其為自由貿易協定，但卻不一定是公平貿易協定。
種苗私財化已經是一種趨勢，對於台灣農民來說，雙邊貿易之下保護品種權絕對是值得關注的問題。台大農藝系教授郭華仁表示，首先在ECFA體制下必須由雙方同意受理各自公告的植物種類，進行保護。也就是說如果買對方一百棵種苗，就只能賣出一百棵，不能將進行種植之後的種子拿去賣。此外品種權還有設置育種家免責條例，如果B育種家針對A育種家研發的品種進行部分誘變，基因轉植，那麼B育種家無法對其誘變的種苗取得專利，此為育種家免責。
李河清表示，根據《遠見》所做的民調中，台灣民眾對於與中國大陸簽訂ECFA條約抱持樂觀態度，認為這是台灣主權獨立的顯現，但是ECFA在內容細目條例都未談妥下就簽訂，不禁讓人以為政治意味多於經濟發展。台灣應關心如何站穩國家主權立場，秉持關心環境愛護地球的態度，與對岸協談能維護國家利益，並且有助於雙邊經貿發展的經濟架構協議。
