為保護國光石化預定地大城濕地，環團提出四大方案，認為台灣並非拉薩姆濕地公約締約國，若將大城濕地公告為國際級濕地僅具宣示效果，不具法律效力，較可行辦法是由內政部依照區域計畫法劃為「自然生態保護區」，施行細則另訂。
澎湖共生藻協會理事長陳昭倫指出，大城濕地就算公告為國際級濕地，缺乏法源依據，實質意義並不大，應改走區域計畫法，劃設為自然生態保護區，以不影響農漁民生計另訂定施行細則，也許是個好辦法。
環保律師詹順貴也認為，透過區域計畫法第7條有關自然資源保育與土地分區管制的規定，搭配其施行細則第13條第10款的「其他使用區」，與同法第15條的「生態保護用地」，訴求劃為「自然生態保護區」，是符合現行法律最好的方式。區域計畫書上可註明凡增加使用強度則應經過許可，並且禁止其他會危害保育標的與保護目的的行為，因此將有法源禁止國光石化建造在大城濕地上。
為保護中華白海豚，陳昭倫另提出3個方案。他指出，野生動物保育法可依國際期刊所發表的離岸3公里至水深30公尺區域劃為白海豚重要棲息地，由法源保護。詹順貴並指出，野保法第10條的「野生動物保護區」比第8條「野生動物重要棲息環境」，更能保護瀕危動物，不允許開發，僅容許學術調查的輕度干擾。
詹順貴補充說，大城濕地即使劃設為野生動物保護區後，也應該擬定保育計畫。只需把保育標的特定為白海豚，其保育計畫可以註明容許現況漁民的使用方式，只是禁止獵捕、污染水域與填海造地等會危害保育標的白海豚生存的相關行為。
至於馬總統表示將研訂細懸浮微粒（PM2.5）環保標準，台灣大學公共衛生學院教授詹長權表示，美國在二2006年、日本在09年，都已經訂出PM2.5空氣品質標準為年平均15微克／立方公尺，日平均35微克／立方公尺，只看環保署有沒有決心而已。
環保署長沈世宏說，世界衛生組織（ＷＨＯ）對於PM2.5只有訂定上限，也就是最終要達到標準是年平均10微克／立方公尺，日平均25微克／立方公尺，給予各國彈性，台灣要找出一個適合自身的標準。
