清流自土地湧出，開展人間生活，餵養萬物生靈。當人類遺忘湧泉的珍貴，誰來保護最後的生物諾亞方舟...
在台灣地質上，有一種湧泉地形，水流自地面冒出，形成一個獨特流域。在早期，人類依水而生，許多村落除了建立在河岸旁，人們也會尋找湧泉地形，作為定居之處。新竹二重埔，就是一個依賴湧泉發展的古老聚落。
龐大的出水量，不只提供生活用水，連灌溉良田的水源也十分充足，於是發展出完整的農村體系。循著山丘邊的自然溪流，走上湧泉的上游，劉慶昌回憶湧泉清澈的水質，日本人曾經用來作澡池。
在龍潭一處湧泉，居民依舊作為洗衣、洗菜之用，保持著與湧泉的自然關係。居民使用湧泉，也會自力擔任清潔工作，保護湧泉正常出水，以及避免垃圾污染水質。
但是人類的使用，在忽略生態觀念下，成為一種佔用，人類從湧泉取水，卻遺忘湧泉也是生物的家園。水中可以發現本土種的魚類，但是水泥化的湧泉源頭，卻讓周遭棲地消失，減少生物多樣性，顯示人類對湧泉的重視，卻造成生物棲地的破壞。
為了瞭解台灣湧泉的現況，生態學者邱郁文展開全台湧泉大調查，他以生態諾亞方舟來形容湧泉，希望研究現今湧泉的生態樣貌，提醒人們關心湧泉生態系的重要。透過文獻蒐集、地名分析，以及向村落耆老請教，找出台灣近百個湧泉區域，再一一前往調查。
研究團隊來到桃園黃泥塘湧泉，早期也做為農業灌溉用途，但是因為農業沒落，自來水使用方便，湧泉開始被忽視，漸漸荒廢。為了確認黃泥塘，是否依舊是湧泉地形，透過底層取水，來測試水源從何而來。黃泥塘湧泉依舊有泉水冒出，但是池塘內的生物捕撈，卻發現外來種入侵的嚴重問題。
研究團隊轉往宜蘭太陽埤，這裡的湧泉地形，地點較為獨立隱蔽，生態樣貌應該會好一些。經過捕撈，發現有本土鰻魚，但是也有大量外來種鱧魚。
外來種入侵的問題，形成湧泉生態的危機，讓一些本土物種，受到排擠與消失，威脅湧泉生態，但是開發破壞，卻造成更大的危害。
研究團隊前往宜蘭柯林湧泉，因為觀光發展，這裡已經規劃成生態湧泉區，提供觀光。研究人員在自然木作步道上，發現一隻本土鱉，正在慢慢爬行。經過捕撈，發現湧泉生態良好，有多個本土物種存在，形成本土物種棲地的諾亞方舟。
研究人員在高興之時，後方卻傳來落石聲，原來在濕地另一頭，一輛卡車正將泥土倒入濕地，掩埋湧泉形成的濕地。在台灣，許多湧泉形成的濕地，原本做為農地使用，但是在開發和觀光的壓力下，一一被填平，或是成為高度水泥化、人工化的觀光埤塘。
原來在蘭嶼各部落中，只有野銀營部落沒有溪流經過，部落族人在很久以前，就知道利用湧泉。達悟人的生態觀，保護湧泉，不只保護水源，就連生物都要保護。李大哥說，部落耆老不會在湧泉區抓鰻魚，因為鰻魚守護湧泉。
湧泉區具有高度生態多樣性，一些珍貴物種也被發現。經過捕撈調查，生物量的豐富，讓人十分驚訝。蘭嶼實踐和諧的用水方法，造就湧泉區的自然生態，族人取水耕作芋頭，其他的水源餵養生物，灌溉森林，呈現尊重分享的生態哲學。
一些生態反思慢慢在出現，羅東林場的蓄木池，也是一個湧泉地形，早期作為蓄木之用，現今轉型朝生態保育發展。經過調查，蓄木池中雖然也有外來種生物，但是原生種的種類、數量也不少。負責管理的羅東林管處，規劃將整個湧泉蓄木池及林業園區，朝向環境教育中心發展。
在國外，保護湧泉生態的思維慢慢在成長，大家都開始思考，湧泉在現代社會的意義。當地底冒出清流，人類開始享用，維繫生命、開創生活，但是不要忘記許多生物，也和人們共享這股清泉。當現今時代，大河污染，山川暴洪，清潔靜謐的湧泉，將是許多生物的天然避難所，成為維繫生存的最後諾亞方舟。
※本節目將在週一晚間10點於公視首播，週六上午11:00重播
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