2005年，第一次聽到綠島珊瑚生病的消息，一直擔心究竟是何種病菌惹的禍，今年聽到學術界證實這「不明病菌」是一種黑色的海綿，這種海綿以入侵者之姿，慢慢的覆蓋住珊瑚，占據牠們的地盤，更驚奇的是，這海綿身上竟然有大量的藍綠菌，藍綠菌如何寄生在海綿身上，控制牠的舉動？腦筋裡突然想到了電影《異形入侵》，在幻想的同時，也憂心台灣的海洋生態系，是否已進入了不平衡的世界。
「嗨！大家好，我住在台灣的海洋裡，已經1,200多年了，我可能是世界上最老的珊瑚吧！很多朋友喜歡來海裡看我，大家把我取名為大香菇，說能夠活到我這個歲數，實在不容易啊！因為我成長很慢，每一年只長1公分，其實我們珊瑚家族，可說是世界上最長命的動物，如果居住環境不錯，我們可以一直活下來，而且年紀愈大，愈不容易死亡哦！唉！可惜的是這幾年我的同伴們，紛紛染上了各種奇奇怪怪的疾病……」
追尋大香菇的故事，我們來到台東富崗漁港，準備搭船前往綠島，雖然夏天已近尾聲，但是想要造訪海洋的遊客，仍是絡繹不絕，在喧鬧的人群中，有一群年輕的學生，手拿著標語，站在碼頭邊，賣力的向搭船的遊客傳遞愛護綠島的做法。
耳邊旋繞著叮嚀的聲音，眼前一片碧海藍天，到底是什麼樣的原因，讓這群年輕學子，聲嘶力竭的為綠島吶喊？一下船就可以找到答案。如果懷抱著浪漫的心情，想來這裡享受海島的悠閒與寧靜，那麼可能先要面對的是川流不息的人群以及機車陣。即使如此，綠島每年還是吸引三、四十萬遊客造訪，因為這座島嶼的海洋，總是散發著難以抵擋的光芒。
不過就在2005年12月，海洋生態學者進行珊瑚礁總體檢時，首度在綠島的柴口浮潛區，發現珊瑚生病了。生病的珊瑚表面有一半呈現黑色，剛開始學術界推測可能是受到不明黴菌或細菌的感染，直到2007年，中研院生物多樣性中心陳昭倫博士的研究團隊，經過採樣切片研究，才確認這黑色的物體是一種海綿，從顯微鏡下觀察，發現這種海綿的身上，還有大量的藍綠菌。
藍綠菌海綿會覆蓋住珊瑚，讓珊瑚走入死亡，在綠島的柴口、公館、中寮、石朗、大白沙、柚子湖等處，都發現黑色海綿入侵，而且族群有日益擴張的趨勢，尤其公館地區，從水深1-16公尺的地方，將近20種珊瑚都逃不過牠們的魔掌。
陳昭倫老師查閱文獻資料，發現這種珊瑚疾病，在日本琉球群島以及關島曾經紀錄過，日本亦稱之為「黑病」，可能跟海岸開發與人為汙染有關，而且一旦遭受海綿入侵，可能會持續30年以上，整個生態系因此變貌。
為了找出病因，結合化學、微生物、生態學等領域的專家，共同組成「調查小組」準備緝兇，初步研判人為的汙水排放，可能是致病的因子之一。研究海洋化學的孟培傑老師進行水質檢測，發現綠島的公館、柴口、石朗海域中的氨氮含量偏高，就是人類的排泄物含量偏高，而這樣的環境最適合藍綠菌生存。巧合的是，公館、柴口、石朗正是綠島「黑病」最嚴重的區域。兇手是否就是廢汙水，仍待進一步研究確認，不過由於綠島並沒有設置任何汙水處理場，學者建議政府應該正視汙水排放的問題。
屋漏偏逢連夜雨，綠島的黑色危機還沒有解除，屏東恆春半島的海洋，卻籠罩在一片慘白的氛圍之下。
穿梭在海洋裡，白色的珊瑚如枯骨般隨處可見。白化是珊瑚生病的警訊，在正常狀況下，珊瑚有著繽紛亮麗的色彩，這些色彩其實是住在珊瑚細胞裡的共生藻所提供的。從顯微鏡下觀察，這圓圓的、黃褐色的細胞就是共生藻，別小看了牠們，珊瑚80%以上的能量，都是靠著共生藻行光合作用而來。一般適合珊瑚生長的水溫是18-28℃之間，如果水溫超過30℃並持續2天以上，珊瑚的共生藻就會慢慢消失、產生白化現象，如果溫度條件沒有改善，珊瑚就會死亡。
今年6月，潛水教練蔡永春在核三廠出水口附近海域，發現珊瑚白化的情況比往年要嚴重許多，由於這片海灣，剛好位於核三廠出水口的右側，每天核三廠排出大量冷卻用的廢熱水，加上今年的海水溫度比以往高上2-3℃，7月還曾出現32-34℃的高溫，珊瑚就像是泡熱水澡一樣，有70%以上的珊瑚白化，到了9月，20-30%的珊瑚已經死亡。
根據研究團隊的監測資料顯示，北從後灣，南到香蕉灣，幾乎整個墾丁國家公園沿岸，都發生了珊瑚白化的現象，離島澎湖、小琉球、東沙、綠島等海域，也觀察到相同的情形，當陳老師把台灣珊瑚白化的訊息往國際傳遞，才驚覺台灣與日本的琉球群島，是目前已知全球珊瑚白化最嚴重的區域之一。
這樣的場景曾經發生過，回想起1998年，是千年來最溫暖的一年，也是海洋最寂靜的一年，當時全世界至少有35個國家、55個地區發生珊瑚白化，台灣海域的珊瑚礁更是一片白色世界；10年過去了，有些地區的生態仍沒有恢復、有些地區的生態系從此改變，研究人員憂心歷史又將重演。
如今白色的珊瑚，就像重症的病人，拖著虛弱的身軀，靜靜等待一絲奇蹟，只要老天垂憐，氣溫不再持續升高；只要等到冬天到來，天氣變冷，生病的珊瑚，就有機會恢復健康，不過人們的消費方式，卻讓珊瑚的病情雪上加霜。這一步又一步的踩踏，等於是給垂死的病人，最後致命的一擊；然而，珊瑚要承受的，還不止於此。
滿地的垃圾充斥著珊瑚礁區，廢棄的漁網纏繞住珊瑚礁，阻礙珊瑚的成長，讓珊瑚無法呼吸，也讓無辜的魚類中網喪命。陳昭倫老師定期來到墾丁國家公園，診斷珊瑚的病情，發現有些病人還染上了黑帶病，身上的組織會逐漸潰爛，最後死亡。
對待病人，本來就該小心呵護、給予最好的照顧，讓牠們有機會恢復元氣。休養是最好的良藥，但是墾丁國家公園的珊瑚，連喘息的機會都沒有。
今年5月，在核三廠出水口的附近海域，剛剛進行一場產卵的盛事，如今珊瑚就得面對死亡的危機，短短的幾個月，珊瑚的生老病死接二連三在海洋裡上演。在這一場黑與白的生死劫難中，海洋的老朋友――綠島的大香菇，是否能躲得過呢？
10年後，你還會重遊綠島嗎？10年後，你還會想來墾丁嗎？10年後的海洋，將會是什麼模樣？
「嗨！大家好，我住在台灣的海洋裡，已經1,200多年了，我可能是世界上最老的珊瑚吧！很多朋友喜歡來海裡看我，把我取名為大香菇，說真的能活到我這個歲數，實在不容易啊！我們來約定一下吧！10年後，甚至20年後，記得喔！一定要再來海裡看我……」
採訪側記
拍攝綠島珊瑚的黑病，墾丁的珊瑚也進入白化的高峰，跟著海洋生態學者多潛一個地點，又會發現珊瑚得了另一種疾病，才驚覺台灣的珊瑚真是體弱多病，現在的海洋環境，實在惡化到讓珊瑚生存不易了！想起多年前製作《戀戀珊瑚礁》時，跑遍各離島，看到珊瑚的悲多於喜，其中最讓人念念不忘的就是綠島的大香菇，想著牠已經在綠島住了1,200年了，這次牠是否可以逃過劫難？很想問一聲：「嗨！大香菇，你還好嗎？」
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