卡玫基颱風剛過，雖然北台灣並未傳出嚴重災情，但豪大風雨帶來的泥沙已嚴重破壞了石門水庫的水質。在第二階段治水預算進入立院審議前夕，立委田秋堇與民間監督團體「水患治理監督聯盟」拿出一瓶來自桃園縣民家中的混濁自來水，質疑第一階段的整治成果。她呼籲相關單位應針對歷時3年耗資140億元天價的第一階段整治計畫，先召開公開通盤的績效檢討，讓全民了解整治的資金花到哪裡去。
田秋堇今（25）日會同水患治理監督聯盟共同召開記者會，她表示，當初為了改善原水濁度飆高而引發停水問題，使通過的石門水庫整治計畫，自2006年迄今第一階段已結束，得到的成果卻是手中的這瓶即使經過自來水廠過濾，仍是「混濁不堪」的自來水。她也呼籲國人在重視中國毒奶粉事件的同時，也該同樣重視用水安全，共同為治水成效把關。
而除了顯現在末端的用水品質問題，水患治理監督聯盟石門小組召集人陳儒東，集水區整治後的情形如同「國在山河破」一般，雖然政府花了大筆經費蓋攔沙壩、建擋土牆，工程達到的效果卻令人質疑。水利專家簡振和另表示，蓋在上游的攔沙壩擋下的大多為巨大石塊，而非預期的砂石。
水患治理監督聯盟林長茂也指出，集水區的農地和民宿超限利用900多公頃，不但破壞水土保持，造成水庫淤積，甚至造成土石流等危險。田秋堇也另指向其主管機關新竹縣及桃園縣政府，呼籲新竹縣長鄭永金與桃園縣長朱立倫「不要再製造災民」，希望該單位不但應為縣民生命安全及用水品質負起責任，也不該讓民眾住在利用水泥工程也無法阻止災害發生的危險地區。
依據水保法第17條縣政府可將集水區劃定為「水土保持特定區」，避免土地利用過當而造成水庫集水區山坡地崩塌，但目前桃園、新竹兩縣政府卻不見行動，任由水庫濁度標高，投入大筆經費卻難看出效果。陳儒東也疾呼，希望能召開第一階段績效評鑑會，為接下來的第二階段找出最有效率的執行方案。
為解決2001-2005年多次風災造成原水濁度標高而引發的缺水危機，立院自2006年1月3日通過預算高達250億的《石門水庫及其集水區整治特別條例》，目前第一階段整治計畫已結束，即將進入第二階段，站在自然保育及資訊公開的角度，由民間主動發起的「水患治理監督聯盟」，希望扮演民眾參與的監督力量。
