中國大陸農業部長江流域漁業資源管理委員會辦公室最近發佈報告指出，長江上游漁業資源嚴重衰退，一些珍稀、特有魚類瀕臨滅絕。更有專家指出，長江生態系統已經崩潰。
燕趙都市報報導，這無疑給這條中華大動脈發出「病危通知書」，為長江生態保護拉響警報。據統計，1968年至1977年的10年間，長江鰣魚年平均產量為49.2萬公斤。從1984年開始，產量急劇下降，1986年僅為1.2萬公斤。如今，江西、湖北、重慶等長江沿岸漁民說，現在基本捕不到鰣魚了。被列為大陸國家一二級野生保護動物的中華鱘、白鱘、達氏鱘、揚子鱷、江豚、胭脂魚、淞江鱸等種群數量也逐年下降。
今年6月，長江漁業資源辦公室邀集科研人員，首次從濕地生態系統、水生生物多樣性、環境流、水環境四個領域，對長江上游進行綜合診斷。在對玉樹、石鼓和赤水3個取樣點的魚類資源採樣結果分析後發現，整個長江上游魚類資源保護面臨重重威脅。
其中金沙江流域歷史監測到魚類有143種，但由於棲息地的破壞和喪失，這次考察僅發現17種魚類樣本。
前長江流域水資源保護局局長、長江經濟技術學會秘書長翁立達等專家表示，長江生物種群和數量減少，除受水汙染、過度捕撈等因素影響外，還有一個重要原因就是失序的水電開發。
據指出，自葛洲壩和三峽工程後，長江水電開發進一步向上游發展。據長江流域綜合利用規劃簡要報告，在長江幹流宜賓至重慶河段規劃了石硼、朱楊溪和小南海水電站，規劃總庫容81億立方公尺。在金沙江，中下游規劃興建梯級電站共12座，裝機總容量為5858萬千瓦，相當於3個三峽工程。
此外，岷江幹流規劃17個電站，大渡河幹流規劃24個電站，雅礱江幹流規劃21個電站，烏江幹流規劃12個電站，嘉陵江幹流規劃17個電站，再加上這些河流的各級支流已存在的電站，整個長江上游水電開發猶如一層層「梯田」。專家預言，照此下去，未來長江上游將成為一個巨大的水庫群，不再是一條奔騰的河流。
大陸的環保專家指出，目前對水力發電環境影響評估，缺乏綜合評估，中長期可能產生的風險無從得知。至於各支流的小水電站，基本沒有環境影響評估。
中國科學院水生生物研究所研究員曹文宣說，如果長江上游這些水力發電開發全部實施，對長江上游珍稀、特有魚類的繁殖、生長將產生無可挽救的影響。
