根據台灣環境資訊協會（以下簡稱環資）日前公佈的2019年度珊瑚礁體檢調查成果，全台灣除了少數樣點的活珊瑚覆蓋率不佳外，其他樣點則為「一般」或「優良」等級，其中又以離島地區及墾丁表現較佳。
然而各地區樣點，不論活珊瑚覆蓋率高低，指標性魚類（如蝶魚、笛鯛及鸚哥魚等）與指標性無脊椎動物（如馬糞海膽、硨磲貝及清潔蝦等）普遍稀少，顯示珊瑚礁區普遍面臨過漁。此外，不少地點也面臨泥沙覆蓋問題，比起往年增加了更多樣點，泥沙沉降將影響珊瑚存活率，使珊瑚面臨更大的威脅。
未來環資擬提出公民科學家、學界及政府攜手共同建立科學化管理機制的構想。藉由珊瑚礁體檢訓練一般潛水員具備基本海洋調查技能，並由志工自行負擔活動費用或差旅費用，一同分攤海洋調查所需的資源及昂貴費用。
離島的活珊瑚覆蓋率較佳 然指標性物種普遍降低 顯示台灣過漁問題
環資於3月1日公佈了2019年度珊瑚礁體檢調查成果，其調查地點遍佈台灣本島與離島，包含野柳、基翬、蘭嶼與澎湖東西嶼坪等，自2019年4月至11月間，號召160人次志工，完成22個樣點的調查，總共累積138筆數據資料。
調查成果顯示，全台除了少數樣點活珊瑚覆蓋率不佳外，其他樣點則是「一般」或「優良」等級。活珊瑚覆蓋率高的樣點多集中在澎湖、綠島、蘭嶼等離島區域及本島的墾丁。澎湖南方四島的三個樣點（東嶼坪西側、東嶼坪南側、西嶼坪南側），蘭嶼的玉女岩、母雞岩，綠島部分樣點及墾丁合界10米穿越線，皆達到國際標準「優良」等級，亦即活珊瑚覆蓋率皆大於50％。
根據成果報告，各地區樣點不論活珊瑚覆蓋率高低，指標性魚類（如蝶魚、笛鯛及鸚哥魚等）與指標性無脊椎動物（如馬糞海膽、硨磲貝及清潔蝦等）普遍稀少。這些指標性生物多具有高經濟價值，時常面臨過漁的威脅，而調查過程也常見到廢棄漁網及漁具纏繞在珊瑚礁上，顯示台灣珊瑚礁區普遍面臨過漁情形。
此外， 除了過漁或海洋廢棄物等威脅外，不少地點（例如：花蓮石梯坪、台東基翬、基隆潮境、番仔澳或龍洞灣）也面臨泥沙覆蓋問題。
泥沙容易在水體中懸浮，影響水層的透光度，間接影響珊瑚體內共生藻光合作用的效率；且泥沙沉降時恐覆蓋在珊瑚表面，進而導致珊瑚窒息死亡。
以往調查時僅在台東基翬較容易觀察到泥沙，然而去（2019）年在多個樣點都有觀察到。台東基翬在去（2019）年5月泥沙覆蓋率更是歷年調查之冠，5米及8米穿越線的泥沙覆蓋率皆高達47.5%。
報告指出 珊瑚礁仍未從莫蘭蒂颱風的侵害中康復
成果報告也指出，台灣部分地區的珊瑚礁還需努力從風災中復原，這除了仰賴自然界本身復原能力外，人為減少干擾也十分重要。
小琉球的珊瑚礁自2016年莫蘭蒂颱風侵襲後，一直未好轉。2019年數據顯示，除漁埕尾10米逐漸恢復外，其他樣點仍不見起色，除了美人洞 10 米處為「一般」等級外，其餘皆為「不佳」等級，最低的為厚石群礁5米，僅有3.1%。
而同樣受到莫蘭蒂颱風影響的還有綠島大白沙，2018年調查結果顯示，大白沙5米活珊瑚覆蓋率由79.4%降至28.1%；大白沙10米處81.9%降至58.8%。2019年，大白沙的活珊瑚覆蓋率與2018年相較，暫無復原跡象。
環資表示，長遠來看，珊瑚礁的復原僅能仰賴本身的生態韌性，然而近年海洋遊憩越趨盛行，在缺乏管理措施下，可能影響當地生態復原能力。呼籲到上述地方或任何其他礁區旅遊觀光的旅客或潛水客，能採用友善環境的旅遊方式，減少對珊瑚製造更多壓力，讓它們能夠休養生息，儘早回復往日榮景。
環資呼籲：公民科學家、學者與政府應攜手合作 共建管理機制
環資也提出未來公民科學家、學界及政府攜手建立科學化管理機制的構想。先以珊瑚礁體檢為起始，訓練一般潛水員具備基本海洋調查技能，並由志工自行負擔活動或差旅費用，與學界一同分攤海洋調查所需的資源及費用。
再者受訓後的潛水員，能夠每年進行全台珊瑚礁區例行性普查，監測是否有異常事件發生，補足學界在人數上的困境。最後與學術單位或政府機關建立溝通平台或橋樑，一旦發現異常事件時，即時通報，由學術單位或政府機關接手，投入資源及人力進行深度研究，瞭解事件發生原因，並且基於調查結果建立後續管理措施或政策，將使珊瑚礁體檢發揮更大效益。
